Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DSG3P32926 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DSG3P32926 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DSG3P32926 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
DSG3P32926 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
DSG3P32926 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
DSG3P32926 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
DSG3P32926 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
DSG3P32926 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
DSG3P32926 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DSG3P32926 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DSG3P32926 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DSG3P32926 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DSG3P32926 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DSG3P32926 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DSG3P32926 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DSG3P32926 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DSG3P32926 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DSG3P32926 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DSG3P32926 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DSG3P32926 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DSG3P32926 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DSG3P32926 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DSG3P32926 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DSG3P32926 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DSG3P32926 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DSG3P32926 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DSG3P32926 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DSG3P32926 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DSG3P32926 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DSG3P32926 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DSG3P32926 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
DSG3P32926 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DSG3P32926 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DSG3P32926 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
DSG3P32926 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DSG3P32926 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DSG3P32926 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DSG3P32926 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DSG3P32926 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DSG3P32926 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DSG3P32926 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DSG3P32926 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DSG3P32926 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DSG3P32926 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DSG3P32926 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
DSG3P32926 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DSG3P32926 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DSG3P32926 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DSG3P32926 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DSG3P32926 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DSG3P32926 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
DSG3P32926 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DSG3P32926 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
DSG3P32926 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
DSG3P32926 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
DSG3P32926 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
DSG3P32926 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
DSG3P32926 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33■■■□□ 2.87
DSG3P32926 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DSG3P32926 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
DSG3P32926 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DSG3P32926 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DSG3P32926 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DSG3P32926 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DSG3P32926 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DSG3P32926 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
DSG3P32926 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DSG3P32926 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DSG3P32926 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DSG3P32926 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
DSG3P32926 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DSG3P32926 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DSG3P32926 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DSG3P32926 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DSG3P32926 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DSG3P32926 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DSG3P32926 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DSG3P32926 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DSG3P32926 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DSG3P32926 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DSG3P32926 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DSG3P32926 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DSG3P32926 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DSG3P32926 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DSG3P32926 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DSG3P32926 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DSG3P32926 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DSG3P32926 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DSG3P32926 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
DSG3P32926 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DSG3P32926 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DSG3P32926 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DSG3P32926 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DSG3P32926 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DSG3P32926 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DSG3P32926 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DSG3P32926 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DSG3P32926 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DSG3P32926 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms