Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
DSG3P32926 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
DSG3P32926 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
DSG3P32926 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
DSG3P32926 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
DSG3P32926 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
DSG3P32926 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
DSG3P32926 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
DSG3P32926 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DSG3P32926 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
DSG3P32926 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
DSG3P32926 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
DSG3P32926 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
DSG3P32926 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
DSG3P32926 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
DSG3P32926 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DSG3P32926 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
DSG3P32926 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
DSG3P32926 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
DSG3P32926 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
DSG3P32926 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DSG3P32926 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DSG3P32926 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DSG3P32926 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DSG3P32926 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DSG3P32926 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DSG3P32926 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DSG3P32926 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DSG3P32926 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
DSG3P32926 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
DSG3P32926 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DSG3P32926 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DSG3P32926 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
DSG3P32926 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
DSG3P32926 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DSG3P32926 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DSG3P32926 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DSG3P32926 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
DSG3P32926 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
DSG3P32926 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
DSG3P32926 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
DSG3P32926 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
DSG3P32926 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
DSG3P32926 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DSG3P32926 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
DSG3P32926 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
DSG3P32926 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
DSG3P32926 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
DSG3P32926 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
DSG3P32926 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
DSG3P32926 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
DSG3P32926 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
DSG3P32926 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
DSG3P32926 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
DSG3P32926 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
DSG3P32926 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
DSG3P32926 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
DSG3P32926 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DSG3P32926 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
DSG3P32926 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
DSG3P32926 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DSG3P32926 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
DSG3P32926 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
DSG3P32926 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
DSG3P32926 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DSG3P32926 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
DSG3P32926 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DSG3P32926 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
DSG3P32926 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DSG3P32926 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DSG3P32926 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DSG3P32926 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
DSG3P32926 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
DSG3P32926 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DSG3P32926 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DSG3P32926 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
DSG3P32926 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
DSG3P32926 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
DSG3P32926 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
DSG3P32926 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
DSG3P32926 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
DSG3P32926 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DSG3P32926 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
DSG3P32926 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
DSG3P32926 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DSG3P32926 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DSG3P32926 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DSG3P32926 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DSG3P32926 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
DSG3P32926 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DSG3P32926 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DSG3P32926 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DSG3P32926 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DSG3P32926 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DSG3P32926 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DSG3P32926 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
DSG3P32926 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DSG3P32926 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
DSG3P32926 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DSG3P32926 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms