Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SEMA4FO95754 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEMA4FO95754 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEMA4FO95754 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA4FO95754 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA4FO95754 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA4FO95754 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEMA4FO95754 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA4FO95754 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA4FO95754 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA4FO95754 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SEMA4FO95754 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA4FO95754 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA4FO95754 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA4FO95754 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA4FO95754 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA4FO95754 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA4FO95754 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA4FO95754 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA4FO95754 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA4FO95754 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4FO95754 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4FO95754 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA4FO95754 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA4FO95754 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA4FO95754 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA4FO95754 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA4FO95754 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA4FO95754 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA4FO95754 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA4FO95754 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA4FO95754 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA4FO95754 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA4FO95754 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA4FO95754 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA4FO95754 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA4FO95754 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA4FO95754 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA4FO95754 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA4FO95754 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA4FO95754 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA4FO95754 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA4FO95754 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA4FO95754 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA4FO95754 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA4FO95754 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA4FO95754 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA4FO95754 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA4FO95754 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA4FO95754 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA4FO95754 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA4FO95754 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA4FO95754 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA4FO95754 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA4FO95754 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA4FO95754 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA4FO95754 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA4FO95754 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA4FO95754 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA4FO95754 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA4FO95754 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA4FO95754 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA4FO95754 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA4FO95754 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA4FO95754 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA4FO95754 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA4FO95754 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA4FO95754 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA4FO95754 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA4FO95754 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4FO95754 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4FO95754 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA4FO95754 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA4FO95754 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA4FO95754 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA4FO95754 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA4FO95754 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA4FO95754 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4FO95754 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA4FO95754 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA4FO95754 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA4FO95754 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA4FO95754 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA4FO95754 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA4FO95754 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA4FO95754 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA4FO95754 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA4FO95754 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA4FO95754 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA4FO95754 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA4FO95754 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA4FO95754 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA4FO95754 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA4FO95754 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA4FO95754 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA4FO95754 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA4FO95754 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA4FO95754 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA4FO95754 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA4FO95754 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms