Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SEMA4FO95754 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SEMA4FO95754 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SEMA4FO95754 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SEMA4FO95754 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SEMA4FO95754 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SEMA4FO95754 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SEMA4FO95754 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SEMA4FO95754 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SEMA4FO95754 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SEMA4FO95754 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SEMA4FO95754 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SEMA4FO95754 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SEMA4FO95754 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SEMA4FO95754 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SEMA4FO95754 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SEMA4FO95754 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SEMA4FO95754 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEMA4FO95754 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SEMA4FO95754 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEMA4FO95754 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SEMA4FO95754 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SEMA4FO95754 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SEMA4FO95754 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SEMA4FO95754 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SEMA4FO95754 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEMA4FO95754 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SEMA4FO95754 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SEMA4FO95754 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SEMA4FO95754 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SEMA4FO95754 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
SEMA4FO95754 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SEMA4FO95754 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SEMA4FO95754 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEMA4FO95754 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEMA4FO95754 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SEMA4FO95754 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SEMA4FO95754 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEMA4FO95754 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SEMA4FO95754 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEMA4FO95754 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SEMA4FO95754 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SEMA4FO95754 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SEMA4FO95754 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SEMA4FO95754 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEMA4FO95754 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEMA4FO95754 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEMA4FO95754 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SEMA4FO95754 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEMA4FO95754 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SEMA4FO95754 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEMA4FO95754 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEMA4FO95754 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEMA4FO95754 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SEMA4FO95754 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA4FO95754 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEMA4FO95754 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEMA4FO95754 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEMA4FO95754 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SEMA4FO95754 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA4FO95754 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA4FO95754 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEMA4FO95754 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEMA4FO95754 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEMA4FO95754 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA4FO95754 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEMA4FO95754 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEMA4FO95754 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA4FO95754 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA4FO95754 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA4FO95754 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEMA4FO95754 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SEMA4FO95754 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SEMA4FO95754 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEMA4FO95754 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA4FO95754 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA4FO95754 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEMA4FO95754 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEMA4FO95754 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEMA4FO95754 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA4FO95754 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA4FO95754 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA4FO95754 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA4FO95754 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEMA4FO95754 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA4FO95754 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA4FO95754 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA4FO95754 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA4FO95754 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA4FO95754 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA4FO95754 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA4FO95754 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA4FO95754 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA4FO95754 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA4FO95754 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA4FO95754 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEMA4FO95754 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA4FO95754 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEMA4FO95754 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SEMA4FO95754 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms