Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF40O75150 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF40O75150 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF40O75150 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF40O75150 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RNF40O75150 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RNF40O75150 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF40O75150 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF40O75150 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF40O75150 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF40O75150 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF40O75150 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF40O75150 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF40O75150 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF40O75150 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF40O75150 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF40O75150 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF40O75150 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF40O75150 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF40O75150 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF40O75150 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF40O75150 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF40O75150 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF40O75150 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF40O75150 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF40O75150 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF40O75150 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF40O75150 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF40O75150 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF40O75150 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF40O75150 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF40O75150 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF40O75150 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF40O75150 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF40O75150 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF40O75150 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
RNF40O75150 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF40O75150 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF40O75150 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF40O75150 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF40O75150 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF40O75150 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RNF40O75150 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF40O75150 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF40O75150 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF40O75150 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF40O75150 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF40O75150 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF40O75150 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF40O75150 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF40O75150 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF40O75150 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF40O75150 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF40O75150 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF40O75150 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF40O75150 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF40O75150 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF40O75150 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF40O75150 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF40O75150 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF40O75150 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF40O75150 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF40O75150 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF40O75150 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF40O75150 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF40O75150 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF40O75150 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF40O75150 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF40O75150 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF40O75150 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF40O75150 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF40O75150 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF40O75150 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RNF40O75150 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF40O75150 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF40O75150 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF40O75150 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF40O75150 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF40O75150 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF40O75150 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF40O75150 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF40O75150 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF40O75150 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF40O75150 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF40O75150 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF40O75150 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF40O75150 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF40O75150 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF40O75150 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF40O75150 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF40O75150 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RNF40O75150 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF40O75150 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF40O75150 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF40O75150 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF40O75150 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF40O75150 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF40O75150 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF40O75150 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF40O75150 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms