Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD23BP54727 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms