RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397022.7

HFE-208, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HFE, Length 1,280 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-208ENST00000397022 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.55■■■■□ 3.92
HFE-208ENST00000397022 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.17■■■■□ 3.22
HFE-208ENST00000397022 ABCC9O60706 1549 aa34.62■■■■□ 3.13
HFE-208ENST00000397022 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.14■■■□□ 2.9
HFE-208ENST00000397022 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.13■■■□□ 2.89
HFE-208ENST00000397022 NACADO15069 1562 aa33.04■■■□□ 2.88
HFE-208ENST00000397022 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
HFE-208ENST00000397022 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.75■■■□□ 2.83
HFE-208ENST00000397022 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.61■■■□□ 2.81
HFE-208ENST00000397022 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.55■■■□□ 2.8
HFE-208ENST00000397022 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.34■■■□□ 2.77
HFE-208ENST00000397022 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.25■■■□□ 2.75
HFE-208ENST00000397022 SCRIBQ14160 1630 aa32.23■■■□□ 2.75
HFE-208ENST00000397022 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.87■■■□□ 2.69
HFE-208ENST00000397022 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.68■■■□□ 2.66
HFE-208ENST00000397022 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
HFE-208ENST00000397022 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.28■■■□□ 2.6
HFE-208ENST00000397022 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.05■■■□□ 2.56
HFE-208ENST00000397022 SMARCA4P51532 1647 aa30.75■■■□□ 2.51
HFE-208ENST00000397022 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
HFE-208ENST00000397022 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.57■■■□□ 2.48
HFE-208ENST00000397022 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.56■■■□□ 2.48
HFE-208ENST00000397022 NCAPD3P42695 1498 aa30.5■■■□□ 2.47
HFE-208ENST00000397022 SMARCA2P51531 1590 aa30.47■■■□□ 2.47
HFE-208ENST00000397022 HMGXB3Q12766 1538 aa30.37■■■□□ 2.45
HFE-208ENST00000397022 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.37■■■□□ 2.45
HFE-208ENST00000397022 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
HFE-208ENST00000397022 WIZO95785 1651 aa30.26■■■□□ 2.43
HFE-208ENST00000397022 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
HFE-208ENST00000397022 NESP48681 1621 aa29.97■■■□□ 2.39
HFE-208ENST00000397022 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
HFE-208ENST00000397022 ERCC6Q03468 1493 aa29.77■■■□□ 2.36
HFE-208ENST00000397022 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.73■■■□□ 2.35
HFE-208ENST00000397022 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.62■■■□□ 2.33
HFE-208ENST00000397022 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.61■■■□□ 2.33
HFE-208ENST00000397022 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.5■■■□□ 2.31
HFE-208ENST00000397022 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
HFE-208ENST00000397022 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.48■■■□□ 2.31
HFE-208ENST00000397022 CFTRP13569 1480 aa29.44■■■□□ 2.3
HFE-208ENST00000397022 CUX2O14529 1486 aa29.42■■■□□ 2.3
HFE-208ENST00000397022 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
HFE-208ENST00000397022 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.34■■■□□ 2.29
HFE-208ENST00000397022 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.29■■■□□ 2.28
HFE-208ENST00000397022 PRDM2Q13029 1718 aa29.28■■■□□ 2.28
HFE-208ENST00000397022 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.27■■■□□ 2.28
HFE-208ENST00000397022 WDR62O43379 1518 aa29.19■■■□□ 2.26
HFE-208ENST00000397022 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
HFE-208ENST00000397022 TOPBP1Q92547 1522 aa28.88■■■□□ 2.21
HFE-208ENST00000397022 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.82■■■□□ 2.2
HFE-208ENST00000397022 ABCC8Q09428 1581 aa28.71■■■□□ 2.19
HFE-208ENST00000397022 CUX1P39880 1505 aa28.67■■■□□ 2.18
HFE-208ENST00000397022 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
HFE-208ENST00000397022 IFT140Q96RY7 1462 aa28.65■■■□□ 2.18
HFE-208ENST00000397022 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
HFE-208ENST00000397022 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.62■■■□□ 2.17
HFE-208ENST00000397022 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
HFE-208ENST00000397022 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.57■■■□□ 2.16
HFE-208ENST00000397022 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.56■■■□□ 2.16
HFE-208ENST00000397022 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
HFE-208ENST00000397022 SOGA1O94964 1423 aa28.46■■■□□ 2.15
HFE-208ENST00000397022 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
HFE-208ENST00000397022 SYNJ1O43426 1573 aa28.41■■■□□ 2.14
HFE-208ENST00000397022 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
HFE-208ENST00000397022 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
HFE-208ENST00000397022 WDR97A6NE52 1622 aa28.36■■■□□ 2.13
HFE-208ENST00000397022 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.36■■■□□ 2.13
HFE-208ENST00000397022 TOP2BQ02880 1626 aa28.34■■■□□ 2.13
HFE-208ENST00000397022 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.22■■■□□ 2.11
HFE-208ENST00000397022 CHD1O14646 1710 aa28.21■■■□□ 2.11
HFE-208ENST00000397022 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.19■■■□□ 2.1
HFE-208ENST00000397022 PBRM1Q86U86 1689 aa28.18■■■□□ 2.1
HFE-208ENST00000397022 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.18■■■□□ 2.1
HFE-208ENST00000397022 OSCARQ8IYS5 282 aa28.17■■■□□ 2.1
HFE-208ENST00000397022 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.15■■■□□ 2.1
HFE-208ENST00000397022 GRIN2BQ13224 1484 aa28.13■■■□□ 2.09
HFE-208ENST00000397022 FBLN2P98095 1184 aa28.1■■■□□ 2.09
HFE-208ENST00000397022 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HFE-208ENST00000397022 SYNJ2O15056 1496 aa27.95■■■□□ 2.07
HFE-208ENST00000397022 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
HFE-208ENST00000397022 ADAMTS12P58397 1594 aa27.93■■■□□ 2.06
HFE-208ENST00000397022 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.88■■■□□ 2.05
HFE-208ENST00000397022 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.88■■■□□ 2.05
HFE-208ENST00000397022 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.88■■■□□ 2.05
HFE-208ENST00000397022 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.86■■■□□ 2.05
HFE-208ENST00000397022 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.84■■■□□ 2.05
HFE-208ENST00000397022 ARHGEF11O15085 1522 aa27.82■■■□□ 2.04
HFE-208ENST00000397022 GRIN2AQ12879 1464 aa27.8■■■□□ 2.04
HFE-208ENST00000397022 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.78■■■□□ 2.04
HFE-208ENST00000397022 TRIM41Q8WV44 630 aa27.78■■■□□ 2.04
HFE-208ENST00000397022 KIF27Q86VH2 1401 aa27.75■■■□□ 2.03
HFE-208ENST00000397022 CEP170Q5SW79 1584 aa27.74■■■□□ 2.03
HFE-208ENST00000397022 IGF1RP08069 1367 aa27.67■■■□□ 2.02
HFE-208ENST00000397022 NUP160Q12769 1436 aa27.67■■■□□ 2.02
HFE-208ENST00000397022 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.66■■■□□ 2.02
HFE-208ENST00000397022 ARAP1Q96P48 1450 aa27.63■■■□□ 2.01
HFE-208ENST00000397022 CUL7Q14999 1698 aa27.62■■■□□ 2.01
HFE-208ENST00000397022 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.56■■■□□ 2
HFE-208ENST00000397022 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.55■■■□□ 2
HFE-208ENST00000397022 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.51■■□□□ 1.99
HFE-208ENST00000397022 SHROOM2Q13796 1616 aa27.49■■□□□ 1.99
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