Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARHGEF6Q15052 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGEF6Q15052 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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