Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TCF3-219ENST00000610756 1343 ntTSL 1 (best)23.21■■□□□ 1.312e-6■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 SEPT5-205ENST00000412544 1108 ntTSL 519.06■□□□□ 0.646e-9■□□□□ 11.1
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PABPC4Q13310 ARFGAP1-204ENST00000395285 2697 ntTSL 218.04■□□□□ 0.488e-7■□□□□ 11.1
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PABPC4Q13310 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.158e-7■□□□□ 11.1
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PABPC4Q13310 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.026e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 11.1
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PABPC4Q13310 AUP1-202ENST00000425118 1581 ntTSL 1 (best)20.12■□□□□ 0.819e-7■□□□□ 11.1
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PABPC4Q13310 AUP1-208ENST00000486234 984 ntTSL 515.45■□□□□ 0.069e-7■□□□□ 11.1
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PABPC4Q13310 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.272e-8■□□□□ 11.1
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PABPC4Q13310 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-8■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-8■□□□□ 11.1
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PABPC4Q13310 POLR3C-202ENST00000369294 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.183e-9■□□□□ 11.1
PABPC4Q13310 POLR3C-201ENST00000334163 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.253e-9■□□□□ 11.1
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PABPC4Q13310 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.611e-6■□□□□ 11
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PABPC4Q13310 PPP1CC-207ENST00000551582 563 ntTSL 45.08□□□□□ -1.62e-23■□□□□ 11
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PABPC4Q13310 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.482e-8■□□□□ 11
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PABPC4Q13310 ICAM5-203ENST00000586480 2599 ntTSL 1 (best)22.78■■□□□ 1.242e-7■□□□□ 11
PABPC4Q13310 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 221.9■■□□□ 1.13e-8■□□□□ 11
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PABPC4Q13310 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.061e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.121e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 SSR2-205ENST00000472467 1833 ntTSL 210.33□□□□□ -0.761e-7■□□□□ 11
PABPC4Q13310 SSR2-212ENST00000488179 1712 ntTSL 510.07□□□□□ -0.81e-7■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-216ENST00000551567 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 328.05■■■□□ 2.081e-9■□□□□ 11
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PABPC4Q13310 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.891e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.561e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-203ENST00000546735 1213 ntTSL 1 (best)17.42■□□□□ 0.381e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 ABCB8-208ENST00000470645 1722 ntTSL 217.39■□□□□ 0.371e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.311e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-211ENST00000549891 932 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.271e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 PRKACA-204ENST00000587372 824 ntTSL 316.38■□□□□ 0.214e-18■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.21e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-212ENST00000550346 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.35■□□□□ 0.051e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 ABCB8-219ENST00000491920 717 ntTSL 214.29□□□□□ -0.121e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-202ENST00000380327 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.181e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-9■□□□□ 11
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