RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551567.1

TROAP-216, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene TROAP, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-216ENST00000551567 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.46■■■■■ 6.79
TROAP-216ENST00000551567 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.49■■■■■ 5.83
TROAP-216ENST00000551567 ABCC9O60706 1549 aa51.15■■■■■ 5.78
TROAP-216ENST00000551567 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.82■■■■■ 5.41
TROAP-216ENST00000551567 NACADO15069 1562 aa48.53■■■■■ 5.36
TROAP-216ENST00000551567 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.36■■■■■ 5.33
TROAP-216ENST00000551567 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.92■■■■■ 5.26
TROAP-216ENST00000551567 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.82■■■■■ 5.25
TROAP-216ENST00000551567 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
TROAP-216ENST00000551567 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.62■■■■■ 5.21
TROAP-216ENST00000551567 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.61■■■■■ 5.21
TROAP-216ENST00000551567 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.46■■■■■ 5.19
TROAP-216ENST00000551567 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.4■■■■■ 5.18
TROAP-216ENST00000551567 SCRIBQ14160 1630 aa46.97■■■■■ 5.11
TROAP-216ENST00000551567 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.73■■■■■ 5.07
TROAP-216ENST00000551567 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.24■■■■■ 4.99
TROAP-216ENST00000551567 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
TROAP-216ENST00000551567 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.01■■■■■ 4.96
TROAP-216ENST00000551567 SMARCA4P51532 1647 aa44.81■■■■■ 4.76
TROAP-216ENST00000551567 NCAPD3P42695 1498 aa44.76■■■■■ 4.76
TROAP-216ENST00000551567 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.71■■■■■ 4.75
TROAP-216ENST00000551567 SMARCA2P51531 1590 aa44.63■■■■■ 4.73
TROAP-216ENST00000551567 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
TROAP-216ENST00000551567 HMGXB3Q12766 1538 aa44.53■■■■■ 4.72
TROAP-216ENST00000551567 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
TROAP-216ENST00000551567 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.32■■■■■ 4.69
TROAP-216ENST00000551567 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.31■■■■■ 4.68
TROAP-216ENST00000551567 ERCC6Q03468 1493 aa44.14■■■■■ 4.66
TROAP-216ENST00000551567 NESP48681 1621 aa44.04■■■■■ 4.64
TROAP-216ENST00000551567 CUX2O14529 1486 aa43.9■■■■■ 4.62
TROAP-216ENST00000551567 WIZO95785 1651 aa43.84■■■■■ 4.61
TROAP-216ENST00000551567 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.76■■■■■ 4.6
TROAP-216ENST00000551567 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
TROAP-216ENST00000551567 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.56■■■■■ 4.56
TROAP-216ENST00000551567 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
TROAP-216ENST00000551567 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.45■■■■■ 4.55
TROAP-216ENST00000551567 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.44■■■■■ 4.54
TROAP-216ENST00000551567 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.41■■■■■ 4.54
TROAP-216ENST00000551567 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
TROAP-216ENST00000551567 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.11■■■■■ 4.49
TROAP-216ENST00000551567 CFTRP13569 1480 aa43.01■■■■■ 4.48
TROAP-216ENST00000551567 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.01■■■■■ 4.48
TROAP-216ENST00000551567 WDR62O43379 1518 aa43■■■■■ 4.47
TROAP-216ENST00000551567 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.98■■■■■ 4.47
TROAP-216ENST00000551567 PRDM2Q13029 1718 aa42.76■■■■■ 4.44
TROAP-216ENST00000551567 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.74■■■■■ 4.43
TROAP-216ENST00000551567 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
TROAP-216ENST00000551567 TOPBP1Q92547 1522 aa42.21■■■■■ 4.35
TROAP-216ENST00000551567 IFT140Q96RY7 1462 aa42.11■■■■■ 4.33
TROAP-216ENST00000551567 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.1■■■■■ 4.33
TROAP-216ENST00000551567 ABCC8Q09428 1581 aa42.09■■■■■ 4.33
TROAP-216ENST00000551567 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
TROAP-216ENST00000551567 OSCARQ8IYS5 282 aa41.9■■■■■ 4.3
TROAP-216ENST00000551567 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
TROAP-216ENST00000551567 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
TROAP-216ENST00000551567 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
TROAP-216ENST00000551567 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
TROAP-216ENST00000551567 TRIM41Q8WV44 630 aa41.77■■■■■ 4.28
TROAP-216ENST00000551567 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.68■■■■■ 4.262e-7■■■■□ 20.1
TROAP-216ENST00000551567 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.65■■■■■ 4.26
TROAP-216ENST00000551567 CUX1P39880 1505 aa41.62■■■■■ 4.25
TROAP-216ENST00000551567 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.6■■■■■ 4.25
TROAP-216ENST00000551567 SOGA1O94964 1423 aa41.58■■■■■ 4.25
TROAP-216ENST00000551567 CHD1O14646 1710 aa41.55■■■■■ 4.24
TROAP-216ENST00000551567 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
TROAP-216ENST00000551567 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
TROAP-216ENST00000551567 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
TROAP-216ENST00000551567 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
TROAP-216ENST00000551567 WDR97A6NE52 1622 aa41.4■■■■■ 4.22
TROAP-216ENST00000551567 FBLN2P98095 1184 aa41.34■■■■■ 4.21
TROAP-216ENST00000551567 ARHGEF11O15085 1522 aa41.32■■■■■ 4.2
TROAP-216ENST00000551567 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.3■■■■■ 4.2
TROAP-216ENST00000551567 GRIN2BQ13224 1484 aa41.2■■■■■ 4.19
TROAP-216ENST00000551567 PBRM1Q86U86 1689 aa41.17■■■■■ 4.18
TROAP-216ENST00000551567 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
TROAP-216ENST00000551567 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.12■■■■■ 4.17
TROAP-216ENST00000551567 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.11■■■■■ 4.17
TROAP-216ENST00000551567 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.08■■■■■ 4.17
TROAP-216ENST00000551567 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.07■■■■■ 4.17
TROAP-216ENST00000551567 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
TROAP-216ENST00000551567 TOP2BQ02880 1626 aa41.04■■■■■ 4.16
TROAP-216ENST00000551567 SYNJ1O43426 1573 aa41.03■■■■■ 4.16
TROAP-216ENST00000551567 SYNJ2O15056 1496 aa41.02■■■■■ 4.16
TROAP-216ENST00000551567 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.02■■■■■ 4.16
TROAP-216ENST00000551567 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.99■■■■■ 4.15
TROAP-216ENST00000551567 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.93■■■■■ 4.14
TROAP-216ENST00000551567 ARAP1Q96P48 1450 aa40.93■■■■■ 4.14
TROAP-216ENST00000551567 ADAMTS12P58397 1594 aa40.76■■■■■ 4.12
TROAP-216ENST00000551567 GRIN2AQ12879 1464 aa40.69■■■■■ 4.1
TROAP-216ENST00000551567 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.62■■■■■ 4.09
TROAP-216ENST00000551567 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.58■■■■■ 4.09
TROAP-216ENST00000551567 CEP170Q5SW79 1584 aa40.57■■■■■ 4.08
TROAP-216ENST00000551567 NUP160Q12769 1436 aa40.51■■■■■ 4.08
TROAP-216ENST00000551567 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.41■■■■■ 4.06
TROAP-216ENST00000551567 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
TROAP-216ENST00000551567 SHROOM2Q13796 1616 aa40.34■■■■■ 4.05
TROAP-216ENST00000551567 KIF27Q86VH2 1401 aa40.2■■■■■ 4.03
TROAP-216ENST00000551567 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.18■■■■■ 4.02
TROAP-216ENST00000551567 CUL7Q14999 1698 aa40.14■■■■■ 4.02
TROAP-216ENST00000551567 IGF1RP08069 1367 aa40.11■■■■■ 4.01
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