Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTPAP49638 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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