Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATE1O95260 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATE1O95260 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATE1O95260 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATE1O95260 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATE1O95260 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATE1O95260 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATE1O95260 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATE1O95260 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATE1O95260 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms