Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATE1O95260 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATE1O95260 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATE1O95260 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATE1O95260 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATE1O95260 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATE1O95260 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATE1O95260 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATE1O95260 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATE1O95260 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATE1O95260 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATE1O95260 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATE1O95260 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATE1O95260 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATE1O95260 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATE1O95260 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATE1O95260 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATE1O95260 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATE1O95260 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATE1O95260 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATE1O95260 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATE1O95260 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATE1O95260 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ATE1O95260 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATE1O95260 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATE1O95260 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATE1O95260 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATE1O95260 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATE1O95260 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATE1O95260 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATE1O95260 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATE1O95260 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATE1O95260 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATE1O95260 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATE1O95260 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATE1O95260 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATE1O95260 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATE1O95260 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATE1O95260 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATE1O95260 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATE1O95260 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATE1O95260 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATE1O95260 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATE1O95260 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATE1O95260 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATE1O95260 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATE1O95260 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATE1O95260 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATE1O95260 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATE1O95260 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATE1O95260 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATE1O95260 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATE1O95260 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATE1O95260 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATE1O95260 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATE1O95260 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATE1O95260 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATE1O95260 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATE1O95260 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATE1O95260 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATE1O95260 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATE1O95260 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATE1O95260 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATE1O95260 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATE1O95260 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATE1O95260 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATE1O95260 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATE1O95260 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATE1O95260 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATE1O95260 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATE1O95260 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATE1O95260 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATE1O95260 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATE1O95260 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATE1O95260 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATE1O95260 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATE1O95260 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATE1O95260 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATE1O95260 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATE1O95260 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATE1O95260 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATE1O95260 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATE1O95260 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATE1O95260 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATE1O95260 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATE1O95260 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATE1O95260 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATE1O95260 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATE1O95260 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATE1O95260 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATE1O95260 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATE1O95260 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATE1O95260 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATE1O95260 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATE1O95260 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATE1O95260 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATE1O95260 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATE1O95260 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATE1O95260 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATE1O95260 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms