RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478808.2

USP30-AS1-201, USP30 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP30-AS1, Length 656 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30-AS1-201ENST00000478808 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.78■■■■■ 4.28
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USP30-AS1-201ENST00000478808 NACADO15069 1562 aa35.51■■■■□ 3.28
USP30-AS1-201ENST00000478808 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.51■■■■□ 3.28
USP30-AS1-201ENST00000478808 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.33■■■■□ 3.25
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USP30-AS1-201ENST00000478808 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.01■■■■□ 3.03
USP30-AS1-201ENST00000478808 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.91■■■■□ 3.02
USP30-AS1-201ENST00000478808 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
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USP30-AS1-201ENST00000478808 SMARCA2P51531 1590 aa32.6■■■□□ 2.81
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USP30-AS1-201ENST00000478808 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.53■■■□□ 2.8
USP30-AS1-201ENST00000478808 HMGXB3Q12766 1538 aa32.51■■■□□ 2.79
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USP30-AS1-201ENST00000478808 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.19■■■□□ 2.74
USP30-AS1-201ENST00000478808 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.08■■■□□ 2.73
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USP30-AS1-201ENST00000478808 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.61■■■□□ 2.65
USP30-AS1-201ENST00000478808 WDR62O43379 1518 aa31.5■■■□□ 2.63
USP30-AS1-201ENST00000478808 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.5■■■□□ 2.63
USP30-AS1-201ENST00000478808 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
USP30-AS1-201ENST00000478808 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.44■■■□□ 2.62
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USP30-AS1-201ENST00000478808 PRDM2Q13029 1718 aa31.18■■■□□ 2.58
USP30-AS1-201ENST00000478808 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
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USP30-AS1-201ENST00000478808 TOPBP1Q92547 1522 aa30.83■■■□□ 2.53
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USP30-AS1-201ENST00000478808 ABCC8Q09428 1581 aa30.79■■■□□ 2.52
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USP30-AS1-201ENST00000478808 WDR97A6NE52 1622 aa30.23■■■□□ 2.43
USP30-AS1-201ENST00000478808 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.22■■■□□ 2.43
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USP30-AS1-201ENST00000478808 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.03■■■□□ 2.4
USP30-AS1-201ENST00000478808 SYNJ2O15056 1496 aa30.02■■■□□ 2.4
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USP30-AS1-201ENST00000478808 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.9■■■□□ 2.38
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USP30-AS1-201ENST00000478808 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.78■■■□□ 2.36
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USP30-AS1-201ENST00000478808 GRIN2AQ12879 1464 aa29.73■■■□□ 2.35
USP30-AS1-201ENST00000478808 ADAMTS12P58397 1594 aa29.7■■■□□ 2.35
USP30-AS1-201ENST00000478808 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.62■■■□□ 2.33
USP30-AS1-201ENST00000478808 CEP170Q5SW79 1584 aa29.62■■■□□ 2.33
USP30-AS1-201ENST00000478808 NUP160Q12769 1436 aa29.59■■■□□ 2.33
USP30-AS1-201ENST00000478808 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.59■■■□□ 2.33
USP30-AS1-201ENST00000478808 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.58■■■□□ 2.33
USP30-AS1-201ENST00000478808 SHROOM2Q13796 1616 aa29.49■■■□□ 2.31
USP30-AS1-201ENST00000478808 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
USP30-AS1-201ENST00000478808 JPH4Q96JJ6 628 aa29.38■■■□□ 2.29
USP30-AS1-201ENST00000478808 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
USP30-AS1-201ENST00000478808 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.27■■■□□ 2.28
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