Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms