Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PADI4Q9UM07 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms