Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ALS2Q96Q42 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ALS2Q96Q42 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms