Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIBP1Q86W92 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms