Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPFIBP1Q86W92 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PPFIBP1Q86W92 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PPFIBP1Q86W92 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPFIBP1Q86W92 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPFIBP1Q86W92 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPFIBP1Q86W92 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PPFIBP1Q86W92 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
PPFIBP1Q86W92 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPFIBP1Q86W92 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PPFIBP1Q86W92 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPFIBP1Q86W92 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PPFIBP1Q86W92 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPFIBP1Q86W92 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PPFIBP1Q86W92 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPFIBP1Q86W92 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PPFIBP1Q86W92 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPFIBP1Q86W92 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPFIBP1Q86W92 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PPFIBP1Q86W92 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPFIBP1Q86W92 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPFIBP1Q86W92 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PPFIBP1Q86W92 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PPFIBP1Q86W92 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PPFIBP1Q86W92 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PPFIBP1Q86W92 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPFIBP1Q86W92 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPFIBP1Q86W92 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PPFIBP1Q86W92 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PPFIBP1Q86W92 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPFIBP1Q86W92 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPFIBP1Q86W92 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPFIBP1Q86W92 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PPFIBP1Q86W92 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPFIBP1Q86W92 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPFIBP1Q86W92 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPFIBP1Q86W92 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPFIBP1Q86W92 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPFIBP1Q86W92 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPFIBP1Q86W92 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPFIBP1Q86W92 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPFIBP1Q86W92 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPFIBP1Q86W92 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPFIBP1Q86W92 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPFIBP1Q86W92 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPFIBP1Q86W92 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPFIBP1Q86W92 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPFIBP1Q86W92 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPFIBP1Q86W92 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PPFIBP1Q86W92 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPFIBP1Q86W92 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPFIBP1Q86W92 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPFIBP1Q86W92 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPFIBP1Q86W92 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPFIBP1Q86W92 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPFIBP1Q86W92 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PPFIBP1Q86W92 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPFIBP1Q86W92 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PPFIBP1Q86W92 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PPFIBP1Q86W92 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPFIBP1Q86W92 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PPFIBP1Q86W92 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PPFIBP1Q86W92 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PPFIBP1Q86W92 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PPFIBP1Q86W92 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPFIBP1Q86W92 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PPFIBP1Q86W92 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PPFIBP1Q86W92 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PPFIBP1Q86W92 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPFIBP1Q86W92 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPFIBP1Q86W92 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPFIBP1Q86W92 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPFIBP1Q86W92 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PPFIBP1Q86W92 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PPFIBP1Q86W92 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PPFIBP1Q86W92 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PPFIBP1Q86W92 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PPFIBP1Q86W92 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PPFIBP1Q86W92 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PPFIBP1Q86W92 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PPFIBP1Q86W92 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PPFIBP1Q86W92 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PPFIBP1Q86W92 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPFIBP1Q86W92 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPFIBP1Q86W92 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PPFIBP1Q86W92 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PPFIBP1Q86W92 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PPFIBP1Q86W92 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PPFIBP1Q86W92 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPFIBP1Q86W92 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPFIBP1Q86W92 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PPFIBP1Q86W92 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PPFIBP1Q86W92 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPFIBP1Q86W92 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPFIBP1Q86W92 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPFIBP1Q86W92 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPFIBP1Q86W92 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPFIBP1Q86W92 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PPFIBP1Q86W92 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PPFIBP1Q86W92 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms