RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222374.2

CADM4-201, Transcript of cell adhesion molecule 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CADM4, Length 2,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4-201ENST00000222374 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.16■■■■■ 6.1
CADM4-201ENST00000222374 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.26■■■■■ 5
CADM4-201ENST00000222374 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
CADM4-201ENST00000222374 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.99■■■■■ 4.63
CADM4-201ENST00000222374 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.91■■■■■ 4.62
CADM4-201ENST00000222374 ABCC9O60706 1549 aa43.72■■■■■ 4.59
CADM4-201ENST00000222374 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.53■■■■■ 4.56
CADM4-201ENST00000222374 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.35■■■■■ 4.53
CADM4-201ENST00000222374 NACADO15069 1562 aa43.07■■■■■ 4.49
CADM4-201ENST00000222374 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.69■■■■■ 4.42
CADM4-201ENST00000222374 SCRIBQ14160 1630 aa42.62■■■■■ 4.41
CADM4-201ENST00000222374 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
CADM4-201ENST00000222374 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.85■■■■■ 4.29
CADM4-201ENST00000222374 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.39■■■■■ 4.22
CADM4-201ENST00000222374 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.32■■■■■ 4.2
CADM4-201ENST00000222374 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
CADM4-201ENST00000222374 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.28■■■■■ 4.2
CADM4-201ENST00000222374 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.08■■■■■ 4.17
CADM4-201ENST00000222374 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
CADM4-201ENST00000222374 SMARCA4P51532 1647 aa40.84■■■■■ 4.13
CADM4-201ENST00000222374 WIZO95785 1651 aa40.77■■■■■ 4.12
CADM4-201ENST00000222374 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
CADM4-201ENST00000222374 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.31■■■■■ 4.04
CADM4-201ENST00000222374 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.18■■■■■ 4.02
CADM4-201ENST00000222374 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
CADM4-201ENST00000222374 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.14■■■■■ 4.02
CADM4-201ENST00000222374 SMARCA2P51531 1590 aa40.12■■■■■ 4.01
CADM4-201ENST00000222374 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
CADM4-201ENST00000222374 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.93■■■■□ 3.98
CADM4-201ENST00000222374 NCAPD3P42695 1498 aa39.77■■■■□ 3.96
CADM4-201ENST00000222374 HMGXB3Q12766 1538 aa39.71■■■■□ 3.95
CADM4-201ENST00000222374 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.54■■■■□ 3.92
CADM4-201ENST00000222374 TRIM41Q8WV44 630 aa39.43■■■■□ 3.9
CADM4-201ENST00000222374 ABCC8Q09428 1581 aa39.15■■■■□ 3.86
CADM4-201ENST00000222374 CFTRP13569 1480 aa38.93■■■■□ 3.82
CADM4-201ENST00000222374 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.9■■■■□ 3.82
CADM4-201ENST00000222374 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.88■■■■□ 3.81
CADM4-201ENST00000222374 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.78■■■■□ 3.8
CADM4-201ENST00000222374 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
CADM4-201ENST00000222374 PRDM2Q13029 1718 aa38.71■■■■□ 3.79
CADM4-201ENST00000222374 SYNJ1O43426 1573 aa38.7■■■■□ 3.79
CADM4-201ENST00000222374 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.54■■■■□ 3.76
CADM4-201ENST00000222374 TOP2BQ02880 1626 aa38.53■■■■□ 3.76
CADM4-201ENST00000222374 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.47■■■■□ 3.75
CADM4-201ENST00000222374 SOGA1O94964 1423 aa38.45■■■■□ 3.75
CADM4-201ENST00000222374 NESP48681 1621 aa38.41■■■■□ 3.74
CADM4-201ENST00000222374 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.4■■■■□ 3.74
CADM4-201ENST00000222374 CUX1P39880 1505 aa38.4■■■■□ 3.74
CADM4-201ENST00000222374 EEA1Q15075 1411 aa38.36■■■■□ 3.73
CADM4-201ENST00000222374 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.36■■■■□ 3.73
CADM4-201ENST00000222374 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.29■■■■□ 3.72
CADM4-201ENST00000222374 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.24■■■■□ 3.71
CADM4-201ENST00000222374 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.19■■■■□ 3.7
CADM4-201ENST00000222374 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.13■■■■□ 3.69
CADM4-201ENST00000222374 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.1■■■■□ 3.69
CADM4-201ENST00000222374 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.01■■■■□ 3.68
CADM4-201ENST00000222374 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.97■■■■□ 3.67
CADM4-201ENST00000222374 TOPBP1Q92547 1522 aa37.94■■■■□ 3.66
CADM4-201ENST00000222374 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.94■■■■□ 3.66
CADM4-201ENST00000222374 KIF27Q86VH2 1401 aa37.89■■■■□ 3.66
CADM4-201ENST00000222374 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
CADM4-201ENST00000222374 GOLGA3Q08378 1498 aa37.86■■■■□ 3.65
CADM4-201ENST00000222374 KIF21BO75037 1637 aa37.85■■■■□ 3.65
CADM4-201ENST00000222374 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
CADM4-201ENST00000222374 CUX2O14529 1486 aa37.77■■■■□ 3.64
CADM4-201ENST00000222374 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.76■■■■□ 3.63
CADM4-201ENST00000222374 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
CADM4-201ENST00000222374 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.73■■■■□ 3.63
CADM4-201ENST00000222374 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.67■■■■□ 3.62
CADM4-201ENST00000222374 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.65■■■■□ 3.62
CADM4-201ENST00000222374 PRXQ9BXM0 1461 aa37.64■■■■□ 3.62
CADM4-201ENST00000222374 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.63■■■■□ 3.61
CADM4-201ENST00000222374 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.6■■■■□ 3.61
CADM4-201ENST00000222374 CEP162Q5TB80 1403 aa37.59■■■■□ 3.61
CADM4-201ENST00000222374 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.58■■■■□ 3.61
CADM4-201ENST00000222374 IGF1RP08069 1367 aa37.54■■■■□ 3.6
CADM4-201ENST00000222374 ERCC6Q03468 1493 aa37.48■■■■□ 3.59
CADM4-201ENST00000222374 WDR97A6NE52 1622 aa37.47■■■■□ 3.59
CADM4-201ENST00000222374 WDR62O43379 1518 aa37.4■■■■□ 3.58
CADM4-201ENST00000222374 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.36■■■■□ 3.57
CADM4-201ENST00000222374 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
CADM4-201ENST00000222374 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
CADM4-201ENST00000222374 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.3■■■■□ 3.56
CADM4-201ENST00000222374 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
CADM4-201ENST00000222374 CLIP1P30622 1438 aa37.27■■■■□ 3.56
CADM4-201ENST00000222374 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.25■■■■□ 3.55
CADM4-201ENST00000222374 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
CADM4-201ENST00000222374 CUL7Q14999 1698 aa37.22■■■■□ 3.55
CADM4-201ENST00000222374 IFT140Q96RY7 1462 aa37.17■■■■□ 3.54
CADM4-201ENST00000222374 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
CADM4-201ENST00000222374 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
CADM4-201ENST00000222374 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.52
CADM4-201ENST00000222374 PBRM1Q86U86 1689 aa37.01■■■■□ 3.52
CADM4-201ENST00000222374 HRCP23327 699 aa37■■■■□ 3.51
CADM4-201ENST00000222374 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
CADM4-201ENST00000222374 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.95■■■■□ 3.51
CADM4-201ENST00000222374 GRIN2BQ13224 1484 aa36.93■■■■□ 3.5
CADM4-201ENST00000222374 ARAP1Q96P48 1450 aa36.86■■■■□ 3.49
CADM4-201ENST00000222374 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.85■■■■□ 3.49
CADM4-201ENST00000222374 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms