Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6L2Q5T890 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6L2Q5T890 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6L2Q5T890 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6L2Q5T890 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6L2Q5T890 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6L2Q5T890 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6L2Q5T890 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ERCC6L2Q5T890 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ERCC6L2Q5T890 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ERCC6L2Q5T890 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ERCC6L2Q5T890 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ERCC6L2Q5T890 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ERCC6L2Q5T890 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ERCC6L2Q5T890 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ERCC6L2Q5T890 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ERCC6L2Q5T890 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
ERCC6L2Q5T890 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6L2Q5T890 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6L2Q5T890 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6L2Q5T890 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ERCC6L2Q5T890 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ERCC6L2Q5T890 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
ERCC6L2Q5T890 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
ERCC6L2Q5T890 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms