Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-212ENST00000491631 879 ntTSL 220.48■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GATA2-204ENST00000489987 1433 ntTSL 220.39■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-210ENST00000486706 918 ntTSL 1 (best)20.14■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-216ENST00000579955 566 ntTSL 420.14■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ABCA2-221ENST00000492260 2062 ntTSL 519.87■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FYTTD1-202ENST00000412924 998 ntTSL 519.75■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYNE4-205ENST00000490730 1175 ntTSL 219.51■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CACTIN-204ENST00000585942 2810 ntTSL 1 (best)19.43■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FYTTD1-206ENST00000426031 491 ntTSL 319.42■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYNE4-204ENST00000465425 2339 ntTSL 219.19■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MAP2K7-206ENST00000475022 1519 ntTSL 1 (best)19.04■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 AIFM3-213ENST00000479523 562 ntTSL 418.97■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-213ENST00000565834 1671 ntTSL 518.85■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC25A51-203ENST00000496760 1871 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MAD1L1-207ENST00000429779 555 ntTSL 418.64■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-203ENST00000460252 682 ntTSL 218.64■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-218ENST00000585208 987 ntTSL 1 (best)18.62■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-211ENST00000490395 1264 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-206ENST00000474716 671 ntTSL 318.43■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FAM19A5-205ENST00000473898 897 ntTSL 218.42■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-208ENST00000563220 1897 ntTSL 218.39■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DPEP1-205ENST00000564281 1772 ntTSL 518.34■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ABCA2-222ENST00000494046 1622 ntTSL 518.34■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CLCN2-210ENST00000636180 3019 ntTSL 518.2■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MBD1-223ENST00000590215 749 ntTSL 518.16■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYT8-205ENST00000424556 1506 ntTSL 518.12■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SRM-206ENST00000490101 461 ntTSL 218.08■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RRP1-202ENST00000471909 2544 ntTSL 1 (best)17.97■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-221ENST00000496878 2269 ntTSL 217.85■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-222ENST00000568034 1085 ntTSL 517.67■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PIAS4-203ENST00000596144 587 ntTSL 317.6■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.336e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 317.05■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-218ENST00000567377 461 ntTSL 317.04■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CLCN2-215ENST00000636661 4378 ntTSL 517.01■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PI4KA-203ENST00000449120 574 ntTSL 416.96■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DGCR8-205ENST00000475941 2669 ntTSL 216.74■□□□□ 0.271e-9■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-220ENST00000567720 544 ntTSL 416.74■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZYX-204ENST00000436448 632 ntTSL 416.7■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYT8-213ENST00000490707 3534 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-217ENST00000584519 677 ntTSL 316.62■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-215ENST00000566843 2284 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-224ENST00000568877 770 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 STX12-202ENST00000440806 718 ntTSL 316.41■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYNE4-207ENST00000505054 713 ntTSL 316.35■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-11■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FAM32A-203ENST00000587351 401 ntTSL 516.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PARK7-205ENST00000460192 567 ntTSL 316.06■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GNAI2-206ENST00000446079 2086 ntTSL 1 (best)16.04■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 AP2A1-206ENST00000600199 2381 ntTSL 515.94■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ABCA2-216ENST00000476211 997 ntTSL 215.93■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GFOD2-204ENST00000602496 2029 ntTSL 515.84■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-215ENST00000497719 721 ntTSL 515.66■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-206ENST00000562610 850 ntTSL 315.45■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CCND1-205ENST00000542367 476 ntTSL 1 (best)15.44■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 01e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 01e-7■■■■■ 52.3
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