RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268797.11

GFOD2-201, Transcript of glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFOD2, Length 2,126 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFOD2-201ENST00000268797 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.76■■■■□ 3.64
GFOD2-201ENST00000268797 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.95■■■□□ 2.87
GFOD2-201ENST00000268797 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
GFOD2-201ENST00000268797 ABCC9O60706 1549 aa31.51■■■□□ 2.63
GFOD2-201ENST00000268797 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.5■■■□□ 2.63
GFOD2-201ENST00000268797 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.12■■■□□ 2.57
GFOD2-201ENST00000268797 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.87■■■□□ 2.53
GFOD2-201ENST00000268797 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.81■■■□□ 2.52
GFOD2-201ENST00000268797 NACADO15069 1562 aa30.76■■■□□ 2.51
GFOD2-201ENST00000268797 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.57■■■□□ 2.48
GFOD2-201ENST00000268797 SCRIBQ14160 1630 aa30.42■■■□□ 2.46
GFOD2-201ENST00000268797 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.99■■■□□ 2.39
GFOD2-201ENST00000268797 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
GFOD2-201ENST00000268797 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.66■■■□□ 2.34
GFOD2-201ENST00000268797 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
GFOD2-201ENST00000268797 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.43■■■□□ 2.3
GFOD2-201ENST00000268797 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
GFOD2-201ENST00000268797 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.21■■■□□ 2.27
GFOD2-201ENST00000268797 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
GFOD2-201ENST00000268797 SMARCA4P51532 1647 aa29.07■■■□□ 2.24
GFOD2-201ENST00000268797 WIZO95785 1651 aa28.99■■■□□ 2.23
GFOD2-201ENST00000268797 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
GFOD2-201ENST00000268797 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.66■■■□□ 2.18
GFOD2-201ENST00000268797 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.66■■■□□ 2.18
GFOD2-201ENST00000268797 SMARCA2P51531 1590 aa28.6■■■□□ 2.17
GFOD2-201ENST00000268797 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
GFOD2-201ENST00000268797 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
GFOD2-201ENST00000268797 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.45■■■□□ 2.15
GFOD2-201ENST00000268797 NCAPD3P42695 1498 aa28.4■■■□□ 2.14
GFOD2-201ENST00000268797 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.36■■■□□ 2.13
GFOD2-201ENST00000268797 HMGXB3Q12766 1538 aa28.33■■■□□ 2.13
GFOD2-201ENST00000268797 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.15■■■□□ 2.1
GFOD2-201ENST00000268797 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.98■■■□□ 2.07
GFOD2-201ENST00000268797 TRIM41Q8WV44 630 aa27.8■■■□□ 2.04
GFOD2-201ENST00000268797 ABCC8Q09428 1581 aa27.76■■■□□ 2.04
GFOD2-201ENST00000268797 CFTRP13569 1480 aa27.74■■■□□ 2.03
GFOD2-201ENST00000268797 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.71■■■□□ 2.03
GFOD2-201ENST00000268797 NESP48681 1621 aa27.6■■■□□ 2.01
GFOD2-201ENST00000268797 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.56■■■□□ 2
GFOD2-201ENST00000268797 PRDM2Q13029 1718 aa27.55■■■□□ 2
GFOD2-201ENST00000268797 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.48■■□□□ 1.99
GFOD2-201ENST00000268797 SYNJ1O43426 1573 aa27.45■■□□□ 1.98
GFOD2-201ENST00000268797 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.42■■□□□ 1.98
GFOD2-201ENST00000268797 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
GFOD2-201ENST00000268797 CUX1P39880 1505 aa27.31■■□□□ 1.96
GFOD2-201ENST00000268797 TOP2BQ02880 1626 aa27.31■■□□□ 1.96
GFOD2-201ENST00000268797 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.3■■□□□ 1.96
GFOD2-201ENST00000268797 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.26■■□□□ 1.95
GFOD2-201ENST00000268797 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.26■■□□□ 1.95
GFOD2-201ENST00000268797 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.22■■□□□ 1.95
GFOD2-201ENST00000268797 SOGA1O94964 1423 aa27.2■■□□□ 1.94
GFOD2-201ENST00000268797 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.16■■□□□ 1.94
GFOD2-201ENST00000268797 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.11■■□□□ 1.93
GFOD2-201ENST00000268797 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.1■■□□□ 1.93
GFOD2-201ENST00000268797 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.09■■□□□ 1.93
GFOD2-201ENST00000268797 TOPBP1Q92547 1522 aa27.09■■□□□ 1.93
GFOD2-201ENST00000268797 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
GFOD2-201ENST00000268797 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.06■■□□□ 1.92
GFOD2-201ENST00000268797 ERCC6Q03468 1493 aa27.03■■□□□ 1.92
GFOD2-201ENST00000268797 EEA1Q15075 1411 aa26.98■■□□□ 1.91
GFOD2-201ENST00000268797 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.96■■□□□ 1.91
GFOD2-201ENST00000268797 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
GFOD2-201ENST00000268797 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.95■■□□□ 1.9
GFOD2-201ENST00000268797 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.91■■□□□ 1.9
GFOD2-201ENST00000268797 CUX2O14529 1486 aa26.87■■□□□ 1.89
GFOD2-201ENST00000268797 KIF27Q86VH2 1401 aa26.87■■□□□ 1.89
GFOD2-201ENST00000268797 WDR62O43379 1518 aa26.8■■□□□ 1.88
GFOD2-201ENST00000268797 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
GFOD2-201ENST00000268797 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.77■■□□□ 1.88
GFOD2-201ENST00000268797 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
GFOD2-201ENST00000268797 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
GFOD2-201ENST00000268797 WDR97A6NE52 1622 aa26.68■■□□□ 1.86
GFOD2-201ENST00000268797 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
GFOD2-201ENST00000268797 GOLGA3Q08378 1498 aa26.66■■□□□ 1.86
GFOD2-201ENST00000268797 KIF21BO75037 1637 aa26.66■■□□□ 1.86
GFOD2-201ENST00000268797 IGF1RP08069 1367 aa26.65■■□□□ 1.86
GFOD2-201ENST00000268797 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.64■■□□□ 1.85
GFOD2-201ENST00000268797 PRXQ9BXM0 1461 aa26.6■■□□□ 1.85
GFOD2-201ENST00000268797 IFT140Q96RY7 1462 aa26.58■■□□□ 1.85
GFOD2-201ENST00000268797 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.58■■□□□ 1.85
GFOD2-201ENST00000268797 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.57■■□□□ 1.84
GFOD2-201ENST00000268797 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.57■■□□□ 1.84
GFOD2-201ENST00000268797 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
GFOD2-201ENST00000268797 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.53■■□□□ 1.84
GFOD2-201ENST00000268797 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GFOD2-201ENST00000268797 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.52■■□□□ 1.84
GFOD2-201ENST00000268797 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.51■■□□□ 1.83
GFOD2-201ENST00000268797 HRCP23327 699 aa26.5■■□□□ 1.83
GFOD2-201ENST00000268797 CEP162Q5TB80 1403 aa26.42■■□□□ 1.82
GFOD2-201ENST00000268797 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GFOD2-201ENST00000268797 PBRM1Q86U86 1689 aa26.42■■□□□ 1.82
GFOD2-201ENST00000268797 CUL7Q14999 1698 aa26.41■■□□□ 1.82
GFOD2-201ENST00000268797 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
GFOD2-201ENST00000268797 GRIN2BQ13224 1484 aa26.37■■□□□ 1.81
GFOD2-201ENST00000268797 CLIP1P30622 1438 aa26.26■■□□□ 1.79
GFOD2-201ENST00000268797 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.25■■□□□ 1.79
GFOD2-201ENST00000268797 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.25■■□□□ 1.79
GFOD2-201ENST00000268797 ADAMTS12P58397 1594 aa26.24■■□□□ 1.79
GFOD2-201ENST00000268797 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
GFOD2-201ENST00000268797 FBLN2P98095 1184 aa26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 196.2 ms