RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412924.5

FYTTD1-202, Transcript of forty-two-three domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene FYTTD1, Length 998 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYTTD1-202ENST00000412924 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.2■■■■■ 6.11
FYTTD1-202ENST00000412924 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.84■■■■■ 5.25
FYTTD1-202ENST00000412924 ABCC9O60706 1549 aa47.61■■■■■ 5.21
FYTTD1-202ENST00000412924 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.47■■■■■ 4.87
FYTTD1-202ENST00000412924 NACADO15069 1562 aa45.17■■■■■ 4.82
FYTTD1-202ENST00000412924 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.72■■■■■ 4.75
FYTTD1-202ENST00000412924 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.62■■■■■ 4.73
FYTTD1-202ENST00000412924 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.47■■■■■ 4.71
FYTTD1-202ENST00000412924 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.38■■■■■ 4.69
FYTTD1-202ENST00000412924 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.23■■■■■ 4.67
FYTTD1-202ENST00000412924 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
FYTTD1-202ENST00000412924 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.05■■■■■ 4.64
FYTTD1-202ENST00000412924 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.04■■■■■ 4.64
FYTTD1-202ENST00000412924 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.66■■■■■ 4.58
FYTTD1-202ENST00000412924 SCRIBQ14160 1630 aa43.46■■■■■ 4.55
FYTTD1-202ENST00000412924 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.06■■■■■ 4.48
FYTTD1-202ENST00000412924 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
FYTTD1-202ENST00000412924 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.93■■■■■ 4.46
FYTTD1-202ENST00000412924 NCAPD3P42695 1498 aa41.66■■■■■ 4.26
FYTTD1-202ENST00000412924 SMARCA4P51532 1647 aa41.51■■■■■ 4.23
FYTTD1-202ENST00000412924 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.5■■■■■ 4.23
FYTTD1-202ENST00000412924 SMARCA2P51531 1590 aa41.47■■■■■ 4.23
FYTTD1-202ENST00000412924 HMGXB3Q12766 1538 aa41.41■■■■■ 4.22
FYTTD1-202ENST00000412924 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
FYTTD1-202ENST00000412924 ERCC6Q03468 1493 aa41.17■■■■■ 4.18
FYTTD1-202ENST00000412924 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.16■■■■■ 4.18
FYTTD1-202ENST00000412924 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
FYTTD1-202ENST00000412924 CUX2O14529 1486 aa41.14■■■■■ 4.18
FYTTD1-202ENST00000412924 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.93■■■■■ 4.14
FYTTD1-202ENST00000412924 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.92■■■■■ 4.14
FYTTD1-202ENST00000412924 NESP48681 1621 aa40.87■■■■■ 4.13
FYTTD1-202ENST00000412924 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.77■■■■■ 4.12
FYTTD1-202ENST00000412924 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
FYTTD1-202ENST00000412924 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.5■■■■■ 4.07
FYTTD1-202ENST00000412924 WIZO95785 1651 aa40.45■■■■■ 4.07
FYTTD1-202ENST00000412924 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.43■■■■■ 4.06
FYTTD1-202ENST00000412924 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.36■■■■■ 4.05
FYTTD1-202ENST00000412924 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.13■■■■■ 4.02
FYTTD1-202ENST00000412924 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
FYTTD1-202ENST00000412924 WDR62O43379 1518 aa40.05■■■■■ 4
FYTTD1-202ENST00000412924 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
FYTTD1-202ENST00000412924 CEP164Q9UPV0 1460 aa40■■■■□ 3.99
FYTTD1-202ENST00000412924 CFTRP13569 1480 aa39.94■■■■□ 3.98
FYTTD1-202ENST00000412924 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.91■■■■□ 3.98
FYTTD1-202ENST00000412924 PRDM2Q13029 1718 aa39.64■■■■□ 3.94
FYTTD1-202ENST00000412924 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
FYTTD1-202ENST00000412924 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.49■■■■□ 3.91
FYTTD1-202ENST00000412924 IFT140Q96RY7 1462 aa39.19■■■■□ 3.86
FYTTD1-202ENST00000412924 ABCC8Q09428 1581 aa39.18■■■■□ 3.86
FYTTD1-202ENST00000412924 TOPBP1Q92547 1522 aa39.16■■■■□ 3.86
FYTTD1-202ENST00000412924 OSCARQ8IYS5 282 aa39.16■■■■□ 3.86
FYTTD1-202ENST00000412924 TRIM41Q8WV44 630 aa39.1■■■■□ 3.85
FYTTD1-202ENST00000412924 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.07■■■■□ 3.84
FYTTD1-202ENST00000412924 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
FYTTD1-202ENST00000412924 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
FYTTD1-202ENST00000412924 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.81
FYTTD1-202ENST00000412924 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
FYTTD1-202ENST00000412924 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
FYTTD1-202ENST00000412924 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
FYTTD1-202ENST00000412924 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
FYTTD1-202ENST00000412924 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.66■■■■□ 3.789e-11■■■□□ 18.4
FYTTD1-202ENST00000412924 CHD1O14646 1710 aa38.59■■■■□ 3.77
FYTTD1-202ENST00000412924 ARHGEF11O15085 1522 aa38.58■■■■□ 3.77
FYTTD1-202ENST00000412924 WDR97A6NE52 1622 aa38.57■■■■□ 3.77
FYTTD1-202ENST00000412924 SOGA1O94964 1423 aa38.56■■■■□ 3.76
FYTTD1-202ENST00000412924 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.54■■■■□ 3.76
FYTTD1-202ENST00000412924 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.53■■■■□ 3.76
FYTTD1-202ENST00000412924 CUX1P39880 1505 aa38.48■■■■□ 3.75
FYTTD1-202ENST00000412924 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
FYTTD1-202ENST00000412924 FBLN2P98095 1184 aa38.39■■■■□ 3.74
FYTTD1-202ENST00000412924 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.34■■■■□ 3.73
FYTTD1-202ENST00000412924 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
FYTTD1-202ENST00000412924 GRIN2BQ13224 1484 aa38.28■■■■□ 3.72
FYTTD1-202ENST00000412924 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
FYTTD1-202ENST00000412924 SYNJ1O43426 1573 aa38.19■■■■□ 3.7
FYTTD1-202ENST00000412924 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.18■■■■□ 3.7
FYTTD1-202ENST00000412924 ARAP1Q96P48 1450 aa38.17■■■■□ 3.7
FYTTD1-202ENST00000412924 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
FYTTD1-202ENST00000412924 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.16■■■■□ 3.7
FYTTD1-202ENST00000412924 SYNJ2O15056 1496 aa38.15■■■■□ 3.7
FYTTD1-202ENST00000412924 PBRM1Q86U86 1689 aa38.15■■■■□ 3.7
FYTTD1-202ENST00000412924 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.13■■■■□ 3.69
FYTTD1-202ENST00000412924 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.12■■■■□ 3.69
FYTTD1-202ENST00000412924 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.08■■■■□ 3.69
FYTTD1-202ENST00000412924 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.97■■■■□ 3.67
FYTTD1-202ENST00000412924 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.95■■■■□ 3.67
FYTTD1-202ENST00000412924 TOP2BQ02880 1626 aa37.94■■■■□ 3.66
FYTTD1-202ENST00000412924 ADAMTS12P58397 1594 aa37.79■■■■□ 3.64
FYTTD1-202ENST00000412924 GRIN2AQ12879 1464 aa37.78■■■■□ 3.64
FYTTD1-202ENST00000412924 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
FYTTD1-202ENST00000412924 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.68■■■■□ 3.62
FYTTD1-202ENST00000412924 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.67■■■■□ 3.62
FYTTD1-202ENST00000412924 NUP160Q12769 1436 aa37.65■■■■□ 3.62
FYTTD1-202ENST00000412924 CEP170Q5SW79 1584 aa37.62■■■■□ 3.61
FYTTD1-202ENST00000412924 SHROOM2Q13796 1616 aa37.5■■■■□ 3.59
FYTTD1-202ENST00000412924 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.46■■■■□ 3.59
FYTTD1-202ENST00000412924 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.26■■■■□ 3.56
FYTTD1-202ENST00000412924 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
FYTTD1-202ENST00000412924 KIF27Q86VH2 1401 aa37.19■■■■□ 3.54
FYTTD1-202ENST00000412924 JPH4Q96JJ6 628 aa37.19■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms