RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.56■■■■■ 4.72
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COMMD4-218ENST00000567377 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.66■■■■□ 3.62
COMMD4-218ENST00000567377 NACADO15069 1562 aa37.55■■■■□ 3.6
COMMD4-218ENST00000567377 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.39■■■■□ 3.58
COMMD4-218ENST00000567377 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.26■■■■□ 3.56
COMMD4-218ENST00000567377 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
COMMD4-218ENST00000567377 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.94■■■■□ 3.5
COMMD4-218ENST00000567377 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.63■■■■□ 3.45
COMMD4-218ENST00000567377 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.6■■■■□ 3.45
COMMD4-218ENST00000567377 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.43■■■■□ 3.42
COMMD4-218ENST00000567377 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.33■■■■□ 3.41
COMMD4-218ENST00000567377 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.21■■■■□ 3.39
COMMD4-218ENST00000567377 SCRIBQ14160 1630 aa36.16■■■■□ 3.38
COMMD4-218ENST00000567377 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
COMMD4-218ENST00000567377 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.46■■■■□ 3.27
COMMD4-218ENST00000567377 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.34■■■■□ 3.25
COMMD4-218ENST00000567377 NCAPD3P42695 1498 aa34.66■■■■□ 3.14
COMMD4-218ENST00000567377 SMARCA4P51532 1647 aa34.62■■■■□ 3.13
COMMD4-218ENST00000567377 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
COMMD4-218ENST00000567377 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.57■■■■□ 3.12
COMMD4-218ENST00000567377 SMARCA2P51531 1590 aa34.55■■■■□ 3.12
COMMD4-218ENST00000567377 HMGXB3Q12766 1538 aa34.42■■■■□ 3.1
COMMD4-218ENST00000567377 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.35■■■■□ 3.09
COMMD4-218ENST00000567377 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.28■■■■□ 3.08
COMMD4-218ENST00000567377 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
COMMD4-218ENST00000567377 ERCC6Q03468 1493 aa33.9■■■■□ 3.02
COMMD4-218ENST00000567377 WIZO95785 1651 aa33.85■■■■□ 3.01
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COMMD4-218ENST00000567377 NESP48681 1621 aa33.79■■■■□ 3
COMMD4-218ENST00000567377 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.77■■■■□ 3
COMMD4-218ENST00000567377 CUX2O14529 1486 aa33.73■■■□□ 2.99
COMMD4-218ENST00000567377 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.63■■■□□ 2.97
COMMD4-218ENST00000567377 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.62■■■□□ 2.97
COMMD4-218ENST00000567377 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
COMMD4-218ENST00000567377 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
COMMD4-218ENST00000567377 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.36■■■□□ 2.93
COMMD4-218ENST00000567377 CFTRP13569 1480 aa33.33■■■□□ 2.93
COMMD4-218ENST00000567377 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.22■■■□□ 2.91
COMMD4-218ENST00000567377 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.19■■■□□ 2.9
COMMD4-218ENST00000567377 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.19■■■□□ 2.9
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.16■■■□□ 2.9
COMMD4-218ENST00000567377 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.14■■■□□ 2.9
COMMD4-218ENST00000567377 WDR62O43379 1518 aa33.1■■■□□ 2.89
COMMD4-218ENST00000567377 PRDM2Q13029 1718 aa32.96■■■□□ 2.87
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COMMD4-218ENST00000567377 ABCC8Q09428 1581 aa32.71■■■□□ 2.83
COMMD4-218ENST00000567377 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
COMMD4-218ENST00000567377 TOPBP1Q92547 1522 aa32.61■■■□□ 2.81
COMMD4-218ENST00000567377 IFT140Q96RY7 1462 aa32.54■■■□□ 2.8
COMMD4-218ENST00000567377 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.54■■■□□ 2.8
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COMMD4-218ENST00000567377 OSCARQ8IYS5 282 aa32.31■■■□□ 2.76
COMMD4-218ENST00000567377 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
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COMMD4-218ENST00000567377 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.12■■■□□ 2.73
COMMD4-218ENST00000567377 WDR97A6NE52 1622 aa32.08■■■□□ 2.73
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COMMD4-218ENST00000567377 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.92■■■□□ 2.7
COMMD4-218ENST00000567377 GRIN2BQ13224 1484 aa31.89■■■□□ 2.7
COMMD4-218ENST00000567377 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.88■■■□□ 2.69
COMMD4-218ENST00000567377 FBLN2P98095 1184 aa31.87■■■□□ 2.69
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COMMD4-218ENST00000567377 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.82■■■□□ 2.68
COMMD4-218ENST00000567377 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.82■■■□□ 2.68
COMMD4-218ENST00000567377 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.81■■■□□ 2.68
COMMD4-218ENST00000567377 CHD1O14646 1710 aa31.8■■■□□ 2.68
COMMD4-218ENST00000567377 TRIM41Q8WV44 630 aa31.79■■■□□ 2.68
COMMD4-218ENST00000567377 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
COMMD4-218ENST00000567377 SYNJ1O43426 1573 aa31.74■■■□□ 2.67
COMMD4-218ENST00000567377 SYNJ2O15056 1496 aa31.72■■■□□ 2.67
COMMD4-218ENST00000567377 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.71■■■□□ 2.67
COMMD4-218ENST00000567377 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.67■■■□□ 2.66
COMMD4-218ENST00000567377 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.67■■■□□ 2.66
COMMD4-218ENST00000567377 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.67■■■□□ 2.66
COMMD4-218ENST00000567377 PBRM1Q86U86 1689 aa31.67■■■□□ 2.66
COMMD4-218ENST00000567377 ARHGEF11O15085 1522 aa31.66■■■□□ 2.66
COMMD4-218ENST00000567377 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.53■■■□□ 2.64
COMMD4-218ENST00000567377 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.5■■■□□ 2.63
COMMD4-218ENST00000567377 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.47■■■□□ 2.63
COMMD4-218ENST00000567377 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.44■■■□□ 2.62
COMMD4-218ENST00000567377 GRIN2AQ12879 1464 aa31.44■■■□□ 2.62
COMMD4-218ENST00000567377 ADAMTS12P58397 1594 aa31.43■■■□□ 2.62
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COMMD4-218ENST00000567377 IGF1RP08069 1367 aa31.22■■■□□ 2.59
COMMD4-218ENST00000567377 CUL7Q14999 1698 aa31.11■■■□□ 2.57
COMMD4-218ENST00000567377 SHROOM2Q13796 1616 aa31.09■■■□□ 2.57
COMMD4-218ENST00000567377 JPH4Q96JJ6 628 aa31.06■■■□□ 2.56
COMMD4-218ENST00000567377 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.03■■■□□ 2.56
COMMD4-218ENST00000567377 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
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