Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTMR3Q13615 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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