Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
MTMR3Q13615 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MTMR3Q13615 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MTMR3Q13615 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MTMR3Q13615 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MTMR3Q13615 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MTMR3Q13615 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MTMR3Q13615 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
MTMR3Q13615 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MTMR3Q13615 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MTMR3Q13615 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MTMR3Q13615 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MTMR3Q13615 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MTMR3Q13615 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MTMR3Q13615 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MTMR3Q13615 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MTMR3Q13615 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MTMR3Q13615 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MTMR3Q13615 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MTMR3Q13615 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MTMR3Q13615 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MTMR3Q13615 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MTMR3Q13615 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
MTMR3Q13615 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
MTMR3Q13615 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MTMR3Q13615 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
MTMR3Q13615 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MTMR3Q13615 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MTMR3Q13615 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MTMR3Q13615 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MTMR3Q13615 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MTMR3Q13615 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MTMR3Q13615 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MTMR3Q13615 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MTMR3Q13615 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MTMR3Q13615 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MTMR3Q13615 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MTMR3Q13615 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MTMR3Q13615 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MTMR3Q13615 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MTMR3Q13615 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
MTMR3Q13615 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
MTMR3Q13615 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
MTMR3Q13615 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MTMR3Q13615 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MTMR3Q13615 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MTMR3Q13615 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MTMR3Q13615 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MTMR3Q13615 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MTMR3Q13615 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
MTMR3Q13615 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MTMR3Q13615 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MTMR3Q13615 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MTMR3Q13615 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MTMR3Q13615 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MTMR3Q13615 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
MTMR3Q13615 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MTMR3Q13615 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MTMR3Q13615 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MTMR3Q13615 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MTMR3Q13615 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MTMR3Q13615 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
MTMR3Q13615 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MTMR3Q13615 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MTMR3Q13615 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MTMR3Q13615 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MTMR3Q13615 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MTMR3Q13615 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MTMR3Q13615 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MTMR3Q13615 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MTMR3Q13615 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
MTMR3Q13615 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MTMR3Q13615 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MTMR3Q13615 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MTMR3Q13615 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MTMR3Q13615 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MTMR3Q13615 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MTMR3Q13615 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MTMR3Q13615 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MTMR3Q13615 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MTMR3Q13615 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MTMR3Q13615 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MTMR3Q13615 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MTMR3Q13615 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MTMR3Q13615 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MTMR3Q13615 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MTMR3Q13615 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MTMR3Q13615 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MTMR3Q13615 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MTMR3Q13615 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MTMR3Q13615 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MTMR3Q13615 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MTMR3Q13615 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MTMR3Q13615 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MTMR3Q13615 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MTMR3Q13615 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MTMR3Q13615 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MTMR3Q13615 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MTMR3Q13615 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MTMR3Q13615 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
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