Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB2Q08289 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNB2Q08289 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB2Q08289 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms