Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL1P47992 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XCL1P47992 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL1P47992 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL1P47992 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL1P47992 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL1P47992 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL1P47992 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL1P47992 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL1P47992 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL1P47992 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL1P47992 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL1P47992 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL1P47992 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL1P47992 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL1P47992 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL1P47992 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL1P47992 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL1P47992 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL1P47992 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL1P47992 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL1P47992 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL1P47992 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL1P47992 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL1P47992 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL1P47992 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL1P47992 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL1P47992 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL1P47992 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL1P47992 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL1P47992 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL1P47992 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL1P47992 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCL1P47992 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCL1P47992 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL1P47992 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL1P47992 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL1P47992 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL1P47992 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL1P47992 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL1P47992 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL1P47992 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCL1P47992 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL1P47992 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL1P47992 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL1P47992 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XCL1P47992 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL1P47992 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms