Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC38■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
KIAA0556O60303 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
KIAA0556O60303 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
KIAA0556O60303 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms