Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms