Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TREML4Q6UXN2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TREML4Q6UXN2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TREML4Q6UXN2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TREML4Q6UXN2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TREML4Q6UXN2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TREML4Q6UXN2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TREML4Q6UXN2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREML4Q6UXN2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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