Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TREML4Q6UXN2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TREML4Q6UXN2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TREML4Q6UXN2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TREML4Q6UXN2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TREML4Q6UXN2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TREML4Q6UXN2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREML4Q6UXN2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TREML4Q6UXN2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TREML4Q6UXN2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML4Q6UXN2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREML4Q6UXN2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TREML4Q6UXN2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREML4Q6UXN2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TREML4Q6UXN2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TREML4Q6UXN2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TREML4Q6UXN2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TREML4Q6UXN2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TREML4Q6UXN2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREML4Q6UXN2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TREML4Q6UXN2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TREML4Q6UXN2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TREML4Q6UXN2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREML4Q6UXN2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREML4Q6UXN2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TREML4Q6UXN2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREML4Q6UXN2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML4Q6UXN2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML4Q6UXN2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TREML4Q6UXN2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TREML4Q6UXN2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TREML4Q6UXN2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREML4Q6UXN2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREML4Q6UXN2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREML4Q6UXN2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREML4Q6UXN2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREML4Q6UXN2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREML4Q6UXN2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREML4Q6UXN2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREML4Q6UXN2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREML4Q6UXN2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREML4Q6UXN2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREML4Q6UXN2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREML4Q6UXN2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREML4Q6UXN2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREML4Q6UXN2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TREML4Q6UXN2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TREML4Q6UXN2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TREML4Q6UXN2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREML4Q6UXN2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TREML4Q6UXN2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREML4Q6UXN2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREML4Q6UXN2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TREML4Q6UXN2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TREML4Q6UXN2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TREML4Q6UXN2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TREML4Q6UXN2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TREML4Q6UXN2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREML4Q6UXN2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TREML4Q6UXN2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TREML4Q6UXN2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREML4Q6UXN2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREML4Q6UXN2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TREML4Q6UXN2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREML4Q6UXN2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREML4Q6UXN2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TREML4Q6UXN2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TREML4Q6UXN2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREML4Q6UXN2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML4Q6UXN2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREML4Q6UXN2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREML4Q6UXN2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREML4Q6UXN2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREML4Q6UXN2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREML4Q6UXN2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREML4Q6UXN2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREML4Q6UXN2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREML4Q6UXN2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREML4Q6UXN2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREML4Q6UXN2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREML4Q6UXN2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TREML4Q6UXN2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREML4Q6UXN2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREML4Q6UXN2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREML4Q6UXN2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREML4Q6UXN2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML4Q6UXN2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREML4Q6UXN2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREML4Q6UXN2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML4Q6UXN2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML4Q6UXN2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREML4Q6UXN2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREML4Q6UXN2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREML4Q6UXN2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREML4Q6UXN2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREML4Q6UXN2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML4Q6UXN2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML4Q6UXN2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML4Q6UXN2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREML4Q6UXN2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms