Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCNT1Q02742 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms