Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GCNT1Q02742 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GCNT1Q02742 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
GCNT1Q02742 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GCNT1Q02742 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GCNT1Q02742 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GCNT1Q02742 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GCNT1Q02742 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GCNT1Q02742 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GCNT1Q02742 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GCNT1Q02742 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GCNT1Q02742 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GCNT1Q02742 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GCNT1Q02742 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GCNT1Q02742 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GCNT1Q02742 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCNT1Q02742 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GCNT1Q02742 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GCNT1Q02742 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GCNT1Q02742 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GCNT1Q02742 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GCNT1Q02742 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GCNT1Q02742 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GCNT1Q02742 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GCNT1Q02742 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GCNT1Q02742 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GCNT1Q02742 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
GCNT1Q02742 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GCNT1Q02742 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GCNT1Q02742 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GCNT1Q02742 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCNT1Q02742 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GCNT1Q02742 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GCNT1Q02742 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GCNT1Q02742 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GCNT1Q02742 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GCNT1Q02742 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GCNT1Q02742 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GCNT1Q02742 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GCNT1Q02742 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GCNT1Q02742 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GCNT1Q02742 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GCNT1Q02742 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GCNT1Q02742 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GCNT1Q02742 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GCNT1Q02742 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GCNT1Q02742 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GCNT1Q02742 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
GCNT1Q02742 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GCNT1Q02742 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GCNT1Q02742 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GCNT1Q02742 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GCNT1Q02742 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GCNT1Q02742 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GCNT1Q02742 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GCNT1Q02742 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GCNT1Q02742 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GCNT1Q02742 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GCNT1Q02742 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GCNT1Q02742 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GCNT1Q02742 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GCNT1Q02742 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GCNT1Q02742 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GCNT1Q02742 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
GCNT1Q02742 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GCNT1Q02742 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GCNT1Q02742 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GCNT1Q02742 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GCNT1Q02742 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GCNT1Q02742 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GCNT1Q02742 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GCNT1Q02742 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GCNT1Q02742 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GCNT1Q02742 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GCNT1Q02742 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GCNT1Q02742 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GCNT1Q02742 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GCNT1Q02742 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GCNT1Q02742 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GCNT1Q02742 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GCNT1Q02742 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GCNT1Q02742 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GCNT1Q02742 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GCNT1Q02742 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GCNT1Q02742 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GCNT1Q02742 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GCNT1Q02742 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
GCNT1Q02742 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GCNT1Q02742 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GCNT1Q02742 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GCNT1Q02742 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GCNT1Q02742 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GCNT1Q02742 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GCNT1Q02742 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GCNT1Q02742 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GCNT1Q02742 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GCNT1Q02742 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GCNT1Q02742 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GCNT1Q02742 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
GCNT1Q02742 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms