Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms