Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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