Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms