RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495490.6

TIMM17B-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-208ENST00000495490 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.44■■■■■ 4.23
TIMM17B-208ENST00000495490 ABCC9O60706 1549 aa37.76■■■■□ 3.63
TIMM17B-208ENST00000495490 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.39■■■■□ 3.58
TIMM17B-208ENST00000495490 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.88■■■■□ 3.33
TIMM17B-208ENST00000495490 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.77■■■■□ 3.32
TIMM17B-208ENST00000495490 NACADO15069 1562 aa35.45■■■■□ 3.27
TIMM17B-208ENST00000495490 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.08■■■■□ 3.21
TIMM17B-208ENST00000495490 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.06■■■■□ 3.2
TIMM17B-208ENST00000495490 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.04■■■■□ 3.2
TIMM17B-208ENST00000495490 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.86■■■■□ 3.17
TIMM17B-208ENST00000495490 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.82■■■■□ 3.16
TIMM17B-208ENST00000495490 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.27■■■■□ 3.08
TIMM17B-208ENST00000495490 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
TIMM17B-208ENST00000495490 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.24■■■■□ 3.07
TIMM17B-208ENST00000495490 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.14■■■■□ 3.06
TIMM17B-208ENST00000495490 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.07■■■■□ 3.05
TIMM17B-208ENST00000495490 SCRIBQ14160 1630 aa34■■■■□ 3.03
TIMM17B-208ENST00000495490 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
TIMM17B-208ENST00000495490 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.24■■■□□ 2.91
TIMM17B-208ENST00000495490 CUX2O14529 1486 aa32.75■■■□□ 2.83
TIMM17B-208ENST00000495490 NCAPD3P42695 1498 aa32.74■■■□□ 2.83
TIMM17B-208ENST00000495490 ERCC6Q03468 1493 aa32.6■■■□□ 2.81
TIMM17B-208ENST00000495490 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.57■■■□□ 2.8
TIMM17B-208ENST00000495490 HMGXB3Q12766 1538 aa32.45■■■□□ 2.78
TIMM17B-208ENST00000495490 SMARCA2P51531 1590 aa32.44■■■□□ 2.78
TIMM17B-208ENST00000495490 SMARCA4P51532 1647 aa32.43■■■□□ 2.78
TIMM17B-208ENST00000495490 NESP48681 1621 aa32.34■■■□□ 2.77
TIMM17B-208ENST00000495490 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
TIMM17B-208ENST00000495490 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
TIMM17B-208ENST00000495490 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.15■■■□□ 2.74
TIMM17B-208ENST00000495490 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
TIMM17B-208ENST00000495490 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.06■■■□□ 2.72
TIMM17B-208ENST00000495490 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.93■■■□□ 2.7
TIMM17B-208ENST00000495490 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.93■■■□□ 2.7
TIMM17B-208ENST00000495490 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.85■■■□□ 2.69
TIMM17B-208ENST00000495490 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.69■■■□□ 2.66
TIMM17B-208ENST00000495490 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.61■■■□□ 2.65
TIMM17B-208ENST00000495490 WDR62O43379 1518 aa31.59■■■□□ 2.65
TIMM17B-208ENST00000495490 WIZO95785 1651 aa31.53■■■□□ 2.64
TIMM17B-208ENST00000495490 TRIM41Q8WV44 630 aa31.51■■■□□ 2.63
TIMM17B-208ENST00000495490 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.39■■■□□ 2.62
TIMM17B-208ENST00000495490 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.33■■■□□ 2.61
TIMM17B-208ENST00000495490 CFTRP13569 1480 aa31.27■■■□□ 2.6
TIMM17B-208ENST00000495490 OSCARQ8IYS5 282 aa31.15■■■□□ 2.58
TIMM17B-208ENST00000495490 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
TIMM17B-208ENST00000495490 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
TIMM17B-208ENST00000495490 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
TIMM17B-208ENST00000495490 PRDM2Q13029 1718 aa30.95■■■□□ 2.55
TIMM17B-208ENST00000495490 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.84■■■□□ 2.53
TIMM17B-208ENST00000495490 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.84■■■□□ 2.53
TIMM17B-208ENST00000495490 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.84■■■□□ 2.53
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
TIMM17B-208ENST00000495490 IFT140Q96RY7 1462 aa30.79■■■□□ 2.52
TIMM17B-208ENST00000495490 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.74■■■□□ 2.51
TIMM17B-208ENST00000495490 TOPBP1Q92547 1522 aa30.71■■■□□ 2.51
TIMM17B-208ENST00000495490 ARHGEF11O15085 1522 aa30.69■■■□□ 2.5
TIMM17B-208ENST00000495490 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
TIMM17B-208ENST00000495490 ABCC8Q09428 1581 aa30.59■■■□□ 2.49
TIMM17B-208ENST00000495490 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.54■■■□□ 2.48
TIMM17B-208ENST00000495490 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
TIMM17B-208ENST00000495490 CHD1O14646 1710 aa30.48■■■□□ 2.47
TIMM17B-208ENST00000495490 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.45■■■□□ 2.474e-6■■■■■ 31
TIMM17B-208ENST00000495490 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.44■■■□□ 2.46
TIMM17B-208ENST00000495490 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
TIMM17B-208ENST00000495490 ARAP1Q96P48 1450 aa30.36■■■□□ 2.45
TIMM17B-208ENST00000495490 FBLN2P98095 1184 aa30.26■■■□□ 2.43
TIMM17B-208ENST00000495490 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.25■■■□□ 2.43
TIMM17B-208ENST00000495490 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
TIMM17B-208ENST00000495490 SOGA1O94964 1423 aa30.19■■■□□ 2.42
TIMM17B-208ENST00000495490 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
TIMM17B-208ENST00000495490 WDR97A6NE52 1622 aa30.14■■■□□ 2.42
TIMM17B-208ENST00000495490 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.13■■■□□ 2.41
TIMM17B-208ENST00000495490 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.12■■■□□ 2.41
TIMM17B-208ENST00000495490 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.09■■■□□ 2.41
TIMM17B-208ENST00000495490 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
TIMM17B-208ENST00000495490 SYNJ1O43426 1573 aa30.03■■■□□ 2.4
TIMM17B-208ENST00000495490 CUX1P39880 1505 aa30.02■■■□□ 2.4
TIMM17B-208ENST00000495490 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
TIMM17B-208ENST00000495490 GRIN2BQ13224 1484 aa29.98■■■□□ 2.39
TIMM17B-208ENST00000495490 SYNJ2O15056 1496 aa29.94■■■□□ 2.38
TIMM17B-208ENST00000495490 PBRM1Q86U86 1689 aa29.87■■■□□ 2.37
TIMM17B-208ENST00000495490 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.82■■■□□ 2.36
TIMM17B-208ENST00000495490 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.76■■■□□ 2.35
TIMM17B-208ENST00000495490 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.76■■■□□ 2.35
TIMM17B-208ENST00000495490 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.62■■■□□ 2.33
TIMM17B-208ENST00000495490 GRIN2AQ12879 1464 aa29.61■■■□□ 2.33
TIMM17B-208ENST00000495490 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
TIMM17B-208ENST00000495490 NUP160Q12769 1436 aa29.55■■■□□ 2.32
TIMM17B-208ENST00000495490 ADAMTS12P58397 1594 aa29.55■■■□□ 2.32
TIMM17B-208ENST00000495490 CEP170Q5SW79 1584 aa29.55■■■□□ 2.32
TIMM17B-208ENST00000495490 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.31
TIMM17B-208ENST00000495490 SHROOM2Q13796 1616 aa29.49■■■□□ 2.31
TIMM17B-208ENST00000495490 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.44■■■□□ 2.3
TIMM17B-208ENST00000495490 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.43■■■□□ 2.3
TIMM17B-208ENST00000495490 TOP2BQ02880 1626 aa29.42■■■□□ 2.3
TIMM17B-208ENST00000495490 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.36■■■□□ 2.29
TIMM17B-208ENST00000495490 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.36■■■□□ 2.29
TIMM17B-208ENST00000495490 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
TIMM17B-208ENST00000495490 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
TIMM17B-208ENST00000495490 JPH4Q96JJ6 628 aa29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms