Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms