Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALD1Q9ULE6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALD1Q9ULE6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALD1Q9ULE6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PALD1Q9ULE6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PALD1Q9ULE6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PALD1Q9ULE6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PALD1Q9ULE6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PALD1Q9ULE6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PALD1Q9ULE6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PALD1Q9ULE6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PALD1Q9ULE6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PALD1Q9ULE6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PALD1Q9ULE6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 954.3 ms