Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP3Q9NS15 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LTBP3Q9NS15 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP3Q9NS15 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
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