Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-206ENST00000528262 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 46.7□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.042e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.648e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 TERT-203ENST00000460137 2992 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.28e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.029e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 RFWD2-203ENST00000367667 2034 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 RFWD2-202ENST00000367666 2022 ntTSL 26.37□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD28-204ENST00000451422 2485 ntTSL 26.55□□□□□ -1.365e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD28-212ENST00000497037 3509 ntTSL 24.13□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD28-206ENST00000461696 1878 ntTSL 34.05□□□□□ -1.765e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.85e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD28-213ENST00000498524 4289 ntTSL 23.58□□□□□ -1.845e-7■■■■■ 34.1
EXOSC5Q9NQT4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 515.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 514.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 214.56□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 LINC01399-201ENST00000423311 648 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 55.35□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 SNX29-204ENST00000564791 1633 ntTSL 1 (best)9.53□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 34
EXOSC5Q9NQT4 MAN1B1-206ENST00000535028 3886 ntTSL 210.1□□□□□ -0.797e-8■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.744e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 ZCCHC7-206ENST00000488607 884 ntTSL 25.06□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.783e-17■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 CCDC138-207ENST00000608781 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 35.21□□□□□ -1.585e-7■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 VRK2-205ENST00000432057 1870 ntTSL 1 (best)16.9■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 33.9
EXOSC5Q9NQT4 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 28.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 33.8
EXOSC5Q9NQT4 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 33.8
EXOSC5Q9NQT4 RERE-211ENST00000469251 355 ntTSL 32.6□□□□□ -1.992e-7■■■■■ 33.8
EXOSC5Q9NQT4 SMYD3-206ENST00000455277 566 ntTSL 57.17□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 33.8
EXOSC5Q9NQT4 COG5-210ENST00000605888 576 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.21□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 33.8
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 33.8
EXOSC5Q9NQT4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.295e-8■■■■■ 33.8
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF18-203ENST00000594665 4616 ntTSL 216.13■□□□□ 0.175e-8■■■■■ 33.8
EXOSC5Q9NQT4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 33.8
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.577e-7■■■■■ 33.8
EXOSC5Q9NQT4 CMC2-206ENST00000563779 2087 ntTSL 1 (best)6.76□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 33.7
EXOSC5Q9NQT4 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 33.7
EXOSC5Q9NQT4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.93e-8■■■■■ 33.7
EXOSC5Q9NQT4 PEX26-204ENST00000474897 2082 ntTSL 516.12■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 33.7
EXOSC5Q9NQT4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 33.7
EXOSC5Q9NQT4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 33.7
EXOSC5Q9NQT4 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 33.7
EXOSC5Q9NQT4 CUL3-207ENST00000451538 546 ntTSL 57.09□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 33.7
EXOSC5Q9NQT4 CUL3-208ENST00000454323 688 ntTSL 35.18□□□□□ -1.586e-7■■■■■ 33.7
EXOSC5Q9NQT4 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.856e-7■■■■■ 33.7
EXOSC5Q9NQT4 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 ATAD2-202ENST00000517666 4995 ntTSL 511.05□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 ATAD2-204ENST00000521496 3133 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.917e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.177e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 ATAD2-203ENST00000519124 4650 ntTSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.517e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 ATAD2-207ENST00000534257 544 ntTSL 44.11□□□□□ -1.757e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-217ENST00000520254 579 ntTSL 415.23■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-208ENST00000518344 554 ntTSL 314.77□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-209ENST00000518879 820 ntTSL 514.67□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-221ENST00000522361 367 ntTSL 414.5□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-219ENST00000521223 587 ntTSL 414.47□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-205ENST00000518167 421 ntTSL 514.45□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-216ENST00000520204 699 ntTSL 512.98□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-211ENST00000519070 561 ntTSL 312.91□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-210ENST00000519020 573 ntTSL 512.54□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-206ENST00000518283 574 ntTSL 47.36□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-203ENST00000517672 548 ntTSL 55.26□□□□□ -1.573e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-228ENST00000523993 581 ntTSL 34.7□□□□□ -1.663e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-213ENST00000519142 696 ntTSL 54.26□□□□□ -1.733e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-222ENST00000522702 544 ntTSL 44.18□□□□□ -1.743e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM49B-225ENST00000523288 4552 ntTSL 23.52□□□□□ -1.853e-7■■■■■ 33.6
EXOSC5Q9NQT4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.324e-9■■■■■ 33.5
EXOSC5Q9NQT4 SLC12A7-204ENST00000513223 1066 ntTSL 512.87□□□□□ -0.354e-9■■■■■ 33.5
EXOSC5Q9NQT4 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 512.01□□□□□ -0.494e-9■■■■■ 33.5
EXOSC5Q9NQT4 TUSC3-213ENST00000515859 1627 ntTSL 520.9■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 33.5
EXOSC5Q9NQT4 TUSC3-210ENST00000510836 1452 ntTSL 520.39■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 33.5
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 78.2 ms