Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC7Q8WUI4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC7Q8WUI4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms