Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 213.49□□□□□ -0.256e-7■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.576e-7■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.232e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 BIRC2-210ENST00000533742 720 ntTSL 213.33□□□□□ -0.282e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.352e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 BIRC2-209ENST00000532832 505 ntTSL 212.53□□□□□ -0.42e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.462e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 BIRC2-212ENST00000534646 562 ntTSL 411.95□□□□□ -0.52e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 BIRC2-203ENST00000527808 709 ntTSL 211.54□□□□□ -0.562e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 USP36-221ENST00000592231 2479 ntTSL 210.19□□□□□ -0.782e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 BIRC2-207ENST00000531259 572 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.812e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 USP36-207ENST00000587010 607 ntTSL 38.79□□□□□ -12e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.172e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 USP36-208ENST00000587379 606 ntTSL 36.58□□□□□ -1.362e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 USP36-219ENST00000591052 427 ntTSL 36.35□□□□□ -1.392e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 BIRC2-202ENST00000527465 595 ntTSL 46.35□□□□□ -1.392e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 USP36-211ENST00000588130 602 ntTSL 25.32□□□□□ -1.562e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 NFE2L2-205ENST00000430047 451 ntTSL 314.44□□□□□ -0.11e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 NFE2L2-210ENST00000462023 521 ntTSL 29.64□□□□□ -0.871e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 NFE2L2-211ENST00000464747 2749 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.251e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 NFE2L2-214ENST00000588123 814 ntTSL 55.78□□□□□ -1.481e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 NFE2L2-213ENST00000586532 942 ntTSL 53.78□□□□□ -1.81e-8■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 15.2
SRSF9Q13242 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.343e-8■■■□□ 15.2
SRSF9Q13242 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-8■■■□□ 15.2
SRSF9Q13242 ABCC1-207ENST00000575422 1198 ntTSL 59.89□□□□□ -0.833e-8■■■□□ 15.2
SRSF9Q13242 ABCC1-204ENST00000572882 4565 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.043e-8■■■□□ 15.2
SRSF9Q13242 ABCC1-208ENST00000576557 542 ntTSL 47.59□□□□□ -1.193e-8■■■□□ 15.2
SRSF9Q13242 ABCC1-203ENST00000572053 744 ntTSL 37.21□□□□□ -1.263e-8■■■□□ 15.2
SRSF9Q13242 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.422e-8■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 HERC4-203ENST00000395185 625 ntTSL 45.4□□□□□ -1.542e-8■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 HERC4-214ENST00000513996 944 ntTSL 35.4□□□□□ -1.542e-8■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.572e-8■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 HERC4-209ENST00000473533 3593 ntTSL 1 (best)4.71□□□□□ -1.662e-8■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.742e-8■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.882e-8■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 SLC26A6-211ENST00000431739 588 ntTSL 39.13□□□□□ -0.952e-8■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 SLC26A6-209ENST00000426599 555 ntTSL 48.8□□□□□ -12e-8■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.378e-7■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.748e-7■■■□□ 15.1
SRSF9Q13242 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.131e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.021e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 314.21□□□□□ -0.131e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 214.21□□□□□ -0.131e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.161e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.191e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 513.84□□□□□ -0.191e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-216ENST00000526710 996 ntTSL 212.7□□□□□ -0.381e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 311.96□□□□□ -0.491e-7■■■□□ 15
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SRSF9Q13242 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.581e-7■■■□□ 15
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SRSF9Q13242 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 510.4□□□□□ -0.741e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.851e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 39.57□□□□□ -0.881e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 59.27□□□□□ -0.931e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 29.17□□□□□ -0.941e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 49.1□□□□□ -0.951e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.981e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 28.48□□□□□ -1.051e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 58.39□□□□□ -1.071e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 38.39□□□□□ -1.071e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 38.32□□□□□ -1.081e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 57.89□□□□□ -1.151e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 35.57□□□□□ -1.521e-7■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-208ENST00000528814 1590 ntTSL 515.06■□□□□ 02e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 GMCL1-202ENST00000468386 808 ntTSL 515.02■□□□□ -02e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-205ENST00000524616 831 ntTSL 313.61□□□□□ -0.232e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.242e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-204ENST00000524409 492 ntTSL 313.07□□□□□ -0.322e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 ATG4B-217ENST00000475693 2237 ntTSL 212.49□□□□□ -0.412e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.562e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 FOXRED1-215ENST00000533395 704 ntTSL 511.43□□□□□ -0.582e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 ATG4B-225ENST00000494465 2365 ntTSL 511.42□□□□□ -0.582e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.592e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-215ENST00000534339 745 ntTSL 511.32□□□□□ -0.62e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 511.16□□□□□ -0.622e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.652e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.652e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.662e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 210.74□□□□□ -0.692e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 210.45□□□□□ -0.742e-8■■■□□ 15
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