RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576557.1

ABCC1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 1, humanhuman

TSL 4

Gene ABCC1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1-208ENST00000576557 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.83■■■□□ 2.53
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ABCC1-208ENST00000576557 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.68■■■□□ 2.02
ABCC1-208ENST00000576557 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.47■■□□□ 1.83
ABCC1-208ENST00000576557 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.44■■□□□ 1.82
ABCC1-208ENST00000576557 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.27■■□□□ 1.8
ABCC1-208ENST00000576557 NACADO15069 1562 aa26.24■■□□□ 1.79
ABCC1-208ENST00000576557 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
ABCC1-208ENST00000576557 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.89■■□□□ 1.74
ABCC1-208ENST00000576557 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.77■■□□□ 1.72
ABCC1-208ENST00000576557 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.73■■□□□ 1.71
ABCC1-208ENST00000576557 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ABCC1-208ENST00000576557 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.39■■□□□ 1.66
ABCC1-208ENST00000576557 SCRIBQ14160 1630 aa25.31■■□□□ 1.64
ABCC1-208ENST00000576557 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.26■■□□□ 1.63
ABCC1-208ENST00000576557 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.21■■□□□ 1.63
ABCC1-208ENST00000576557 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.19■■□□□ 1.62
ABCC1-208ENST00000576557 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ABCC1-208ENST00000576557 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.36■■□□□ 1.49
ABCC1-208ENST00000576557 NCAPD3P42695 1498 aa24.25■■□□□ 1.47
ABCC1-208ENST00000576557 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.16■■□□□ 1.46
ABCC1-208ENST00000576557 ERCC6Q03468 1493 aa24.15■■□□□ 1.46
ABCC1-208ENST00000576557 CUX2O14529 1486 aa24.09■■□□□ 1.45
ABCC1-208ENST00000576557 SMARCA4P51532 1647 aa24.09■■□□□ 1.45
ABCC1-208ENST00000576557 SMARCA2P51531 1590 aa24.06■■□□□ 1.44
ABCC1-208ENST00000576557 HMGXB3Q12766 1538 aa24.01■■□□□ 1.43
ABCC1-208ENST00000576557 NESP48681 1621 aa23.99■■□□□ 1.43
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ABCC1-208ENST00000576557 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.8■■□□□ 1.4
ABCC1-208ENST00000576557 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.79■■□□□ 1.4
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ABCC1-208ENST00000576557 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.7■■□□□ 1.38
ABCC1-208ENST00000576557 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.64■■□□□ 1.37
ABCC1-208ENST00000576557 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.6■■□□□ 1.37
ABCC1-208ENST00000576557 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.52■■□□□ 1.36
ABCC1-208ENST00000576557 WIZO95785 1651 aa23.51■■□□□ 1.35
ABCC1-208ENST00000576557 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCC1-208ENST00000576557 WDR62O43379 1518 aa23.33■■□□□ 1.33
ABCC1-208ENST00000576557 TRIM41Q8WV44 630 aa23.3■■□□□ 1.32
ABCC1-208ENST00000576557 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.29■■□□□ 1.32
ABCC1-208ENST00000576557 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.26■■□□□ 1.31
ABCC1-208ENST00000576557 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ABCC1-208ENST00000576557 CFTRP13569 1480 aa23.19■■□□□ 1.3
ABCC1-208ENST00000576557 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
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ABCC1-208ENST00000576557 OSCARQ8IYS5 282 aa23.05■■□□□ 1.28
ABCC1-208ENST00000576557 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCC1-208ENST00000576557 PRDM2Q13029 1718 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCC1-208ENST00000576557 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ABCC1-208ENST00000576557 IFT140Q96RY7 1462 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCC1-208ENST00000576557 TOPBP1Q92547 1522 aa22.8■■□□□ 1.24
ABCC1-208ENST00000576557 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.74■■□□□ 1.23
ABCC1-208ENST00000576557 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.74■■□□□ 1.23
ABCC1-208ENST00000576557 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.74■■□□□ 1.23
ABCC1-208ENST00000576557 ABCC8Q09428 1581 aa22.7■■□□□ 1.22
ABCC1-208ENST00000576557 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCC1-208ENST00000576557 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ABCC1-208ENST00000576557 ARHGEF11O15085 1522 aa22.64■■□□□ 1.21
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ABCC1-208ENST00000576557 FBLN2P98095 1184 aa22.58■■□□□ 1.21
ABCC1-208ENST00000576557 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.57■■□□□ 1.2
ABCC1-208ENST00000576557 CHD1O14646 1710 aa22.56■■□□□ 1.2
ABCC1-208ENST00000576557 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ABCC1-208ENST00000576557 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCC1-208ENST00000576557 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ABCC1-208ENST00000576557 SOGA1O94964 1423 aa22.48■■□□□ 1.19
ABCC1-208ENST00000576557 ARAP1Q96P48 1450 aa22.41■■□□□ 1.18
ABCC1-208ENST00000576557 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.41■■□□□ 1.18
ABCC1-208ENST00000576557 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ABCC1-208ENST00000576557 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.37■■□□□ 1.17
ABCC1-208ENST00000576557 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ABCC1-208ENST00000576557 CUX1P39880 1505 aa22.35■■□□□ 1.17
ABCC1-208ENST00000576557 WDR97A6NE52 1622 aa22.28■■□□□ 1.16
ABCC1-208ENST00000576557 GRIN2BQ13224 1484 aa22.27■■□□□ 1.16
ABCC1-208ENST00000576557 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.26■■□□□ 1.15
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ABCC1-208ENST00000576557 SYNJ1O43426 1573 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCC1-208ENST00000576557 SYNJ2O15056 1496 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC1-208ENST00000576557 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ABCC1-208ENST00000576557 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCC1-208ENST00000576557 PBRM1Q86U86 1689 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC1-208ENST00000576557 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCC1-208ENST00000576557 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCC1-208ENST00000576557 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
ABCC1-208ENST00000576557 GRIN2AQ12879 1464 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCC1-208ENST00000576557 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.97■■□□□ 1.11
ABCC1-208ENST00000576557 ADAMTS12P58397 1594 aa21.93■■□□□ 1.1
ABCC1-208ENST00000576557 CEP170Q5SW79 1584 aa21.92■■□□□ 1.1
ABCC1-208ENST00000576557 TOP2BQ02880 1626 aa21.91■■□□□ 1.1
ABCC1-208ENST00000576557 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.91■■□□□ 1.1
ABCC1-208ENST00000576557 NUP160Q12769 1436 aa21.89■■□□□ 1.1
ABCC1-208ENST00000576557 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.89■■□□□ 1.09
ABCC1-208ENST00000576557 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ABCC1-208ENST00000576557 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCC1-208ENST00000576557 SHROOM2Q13796 1616 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCC1-208ENST00000576557 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ABCC1-208ENST00000576557 JPH4Q96JJ6 628 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC1-208ENST00000576557 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.64■■□□□ 1.05
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