Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
GRIN2BQ13224 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.76■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.95
GRIN2BQ13224 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GRIN2BQ13224 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
GRIN2BQ13224 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC39.56■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC39.55■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
GRIN2BQ13224 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GRIN2BQ13224 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
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