Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK17Q00537 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms