Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVK-24P63145 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVK-24P63145 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVK-24P63145 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVK-24P63145 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVK-24P63145 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERVK-24P63145 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVK-24P63145 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVK-24P63145 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-24P63145 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-24P63145 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-24P63145 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-24P63145 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-24P63145 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-24P63145 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-24P63145 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERVK-24P63145 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERVK-24P63145 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERVK-24P63145 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERVK-24P63145 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVK-24P63145 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ERVK-24P63145 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ERVK-24P63145 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVK-24P63145 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ERVK-24P63145 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ERVK-24P63145 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERVK-24P63145 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms