Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AMTP48728 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AMTP48728 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMTP48728 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMTP48728 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMTP48728 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMTP48728 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMTP48728 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AMTP48728 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AMTP48728 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AMTP48728 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMTP48728 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMTP48728 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMTP48728 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMTP48728 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AMTP48728 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMTP48728 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMTP48728 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMTP48728 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMTP48728 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMTP48728 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AMTP48728 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMTP48728 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AMTP48728 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMTP48728 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMTP48728 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMTP48728 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AMTP48728 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMTP48728 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMTP48728 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMTP48728 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMTP48728 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMTP48728 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMTP48728 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMTP48728 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMTP48728 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AMTP48728 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AMTP48728 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AMTP48728 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms